Caracterización morfológica de hongos y bacterias de suelo, agua y sedimento en la cuenca de la Quebrada Lizama

Study Extent

Seis localidades a lo largo de la cuenca de la Quebrada Lizama y Caño Muerto, desde la zona del derrame del pozo 158 hacia su desembocadura en el Río Sogamoso, municipios de Barrancabermeja y San Vicente de Chucurí, en el departamento de Santander.

Sampling

Por medio de la técnica de dilución seriada se realizó el aislamiento en laboratorio de bacterias de muestras de agua, suelo y sedimento y de hongos de muestras de suelo y sedimento. Para el aislamiento se hicieron diluciones de las muestras hasta un factor de 10^-7 en medios de agar Papa Dextrosa (PDA) con cloranfenicol 50mg/l, Agar Rosa de Bengala (ARB), y Agar Nutritivo a un medio de concentración (1/2 AN) con cicloheximida. Para el aislamiento de hongos transitorios a partir de muestras de agua se utilizó la técnica de filtración al vacío en filtro de tamaño de por 0.45μm. Las bacterias fueron conservadas en caldo nutritivo con glicerol 30% en refrigeración a -80ºC y los hongos en papel filtro a partir de monospóricos.

Method steps

1. Por medio de la técnica de dilución seriada se realizó el aislamiento en laboratorio de bacterias de muestras de agua, suelo y sedimento y de hongos de muestras de suelo y sedimento. Para el aislamiento se hicieron diluciones de las muestras hasta un factor de 10^-7. Para el aislamiento de hongos se realizaron siembras en superficie por triplicado de las diluciones 10^-1,10^-3 y 10^-5 en agar Papa Dextrosa (PDA) con cloranfenicol 50mg/l y Agar Rosa de Bengala (ARB), medio que inhibe el crecimiento de bacterias y limita el tamaño y la altura de los hongos con crecimiento rápido lo cual permite el aislamiento de colonias sin que estas se sobrelapen. Para aquellas muestras donde no hubo crecimiento se repitió el proceso sembrando en superficie la muestra directa (100) y su dilución 10^-1. Para el aislamiento de bacterias inicialmente se realizaron siembras en superficie de las diluciones 10^-5, 10^-6 y 10^-7 en Agar Nutritivo a un medio de concentración (1/2 AN) con cicloheximida, dado que no se obtuvieron recuentos se repitió el proceso sembrando las diluciones 10^-1,10^-2, 10^-3 y 10^-4. Para el aislamiento de hongos transitorios a partir de muestras de agua se utilizó la técnica de filtración al vacío en filtro de tamaño de por 0.45μm. Las bacterias se conservarán en caldo nutritivo con glicerol 30% en refrigeración a -80ºC y los hongos en papel filtro a partir de monospóricos. Con el fin de caracterizar la morfología de los hongos se realizó descripción macroscópica (color colonia anverso y reverso, pigmento al medio y apariencia) y descripción microscópica que permitió la identificación hasta el grado taxonómico mas específico posible. Para bacterias se realizó descripción macroscópica de las colonias (forma, color, borde, elevación y textura) e identificación molecular basada en el ADNr 16S, para su amplificación se usaron los cebadores 27F (5'-AGA GTT TGA TCM TGG CTC AG-3') y 1492R (5'-CGG TTA CCT TGT TAC GAC TT-3').

El presente conjunto de datos contiene 164 registros de hongos y bacterias a diferentes jerarquías taxonómicas.

1. Bacteria
   common name: bacterias rank: domain
2. Fungi
   common name: hongos rank: kingdom

Área circundante a la cuenca de la Quebrada Lizama y el Caño Muerto, en los municipios de Barrancabermeja y San Vicente de Chucurí, departamento de Santander.