Bacterias identificadas en la producción de queso a pequeña escala en 14 municipios del departamento de Risaralda

Study Extent

La toma de muestras de queso fresco y leche cruda se realizó en el departamento de Risaralda, espcificamente en los municipios de Apia, Belén de Umbría, Dosquebradas, Marsella, Mistrató, Pereira, Pueblo Rico, Quinchía, Santa Rosa de Cabal y Santuario.

Sampling

Para la toma de muestras se identifico a los productores de leche y queso fresco que hubieran participado en el proyecto de investigación “Desarrollo de capacidades científicas y tecnológicas en biotecnología aplicada a los sectores de la salud y la agroindustria en el departamento de Risaralda”. Una vez se identifico a los productores, se realizó una visita a los municipios identificados con pequeños productores de queso fresco. En esta visita se obtuvo una base de datos la cual incluye la información de la georreferenciación de los predios e información general de los pequeños productores del cual se obtuvieron las muestras de este recurso. La toma de muestras de queso fresco y leche cruda se realizó en los municipios de Apia, Belén de Umbría, Dosquebradas, Marsella, Mistrató, Pereira, Pueblo Rico, Quinchía, Santa Rosa de Cabal y Santuario. Estas muestras fueron identificadas mediante un código consecutivo comenzando en 01-18 hasta 31-18. Se diligencio el formato acta toma y recepción de muestras con código L-FI-TM-23 donde se almacenan los datos de tipo demuestra y datos de contacto de predio. Una vez se realiza la toma de las muestras, se procede a almacenar en las neveras isotérmicas con geles de refrigeración para su transporte a la Universidad Libre, Seccional Pereira donde se procede al análisis fisicoquímico y microbiológicos de los quesos recolectados.

Quality Control

En el proceso de estructuración y validación de los datos, se realizó el control de la calidad de la información. A continuación, se enumeran los procesos asociados a esta actividad: 1. Revisión de la información documentada asociada a los datos biológicos; 2. Estructuración de los datos en el estándar Darwin Core (DwC) según elementos, definiciones y vocabularios controlados; 3. Validación y limpieza de la información consignada en el DwC, 3.1. Corrección de errores de tipeo, para esta tarea se usó OpenRefine, adicionalmente se identificaron datos erróneos haciendo uso del Validador de datos - GBIF.

Method steps

1. La metodología de análisis microbilógico consistió: - Las muestras se almacenaron a 4 °C hasta su posterior análisis microbiológicos, el cual fue realizado antes de las 24 horas de colecta de las muestras. - Las muestras de queso fueron fraccionadas en alícuotas de 50-60 g y almacenados a -20 °C para posteriores análisis. - Los análisis microbiológicos se realizaron siguiendo la metodología recomendada para el recuento en placa de mesófilos, S. aureus, mohos y levaduras y detección de Salmonella se emplearon placas 3M Petrifilm y para la determinación de L. monocytogenes se realizaron pruebas de identificación en placas de medio de cultivo Aloa, y posterior confirmación bioquímica con Api 50. - Para la determinación de coliformes totales y fecales se realizó mediante la técnica de número más probable (NMP) utilizando placas de Simplate siguiendo el protocolo de la técnica. - Pasado el tiempo de incubación se realizó el registro L-R-T-04 de los resultados obtenidos para cada uno de los microorganismos y posteriormente fueron tabulados.
2. Los análisis microbiológicos contaron con los parámetros establecidos por la normativa decreto 1880 de 2011. En leche cruda consistió en el recuento de mesófilos aerobios por la técnica de recuento en placa 3M Petrifilm para este tipo de microorganismo según AOAC 986.33. Por otro lado, el análisis del queso consistió en el recuento de mohos y levaduras según AOCAC 997.02, Staphylococcus aureus coagulasa positiva según AOAC 2003.07, detección de salmonella según AOCAC 2014.01, determinación de L. monocytogenes según ISO 11290-1:2017 por la técnica de recuento en placa y enumeración de coliformes fecales por la técnica de NMP según AOAC 2005.03.
3. Para garantizar los procesos desarrollados en el análisis de muestras en el laboratorio de la Universidad Libre se realizaron los siguientes controles: control de ambientes y superficies de laboratorio (código L-R-CC-03), control de esterilización (código L-R-T-10), control de condiciones ambientales (código L-R-CC-13), control de temperatura de equipos (código ULPM-LINV-CT01, ULPM-LINV-CT02 y ULPM-LINV-CT05), control de técnicas microbiológicas (código L-R-T-05) y registro gasto de medios de cultivo y reactivos (código L-R-T06).

Este conjunto de datos comprende 88 registros biológicos del reino Bacteria. Se encuentran distribuidos en 2 filos, 2 clases, 3 ordenes, 4 familias, 4 géneros y 3 especies. Un 67.04% está clasificado a nivel de especie y 32.95% a género.

1. Limosilactobacillus
   rank: genus
2. Listeria
   rank: genus
3. Salmonella
   rank: genus
4. Staphylococcus
   rank: genus

La toma de muestras de queso fresco y leche cruda se realizó en el departamento de Risaralda, espcificamente en los municipios de Apia, Belén de Umbría, Dosquebradas, Marsella, Mistrató, Pereira, Pueblo Rico, Quinchía, Santa Rosa de Cabal y Santuario.