Colección Biológica Universidad EAFIT

Study Extent

La Colección Biológica Universidad EAFIT custodia especímenes de 33 municipios en ocho de los 32 departamentos de Colombia: Antioquia, Caldas, Chocó, Córdoba, Cundinamarca, La Guajira, Quindío y Risaralda.

Sampling

Muestreo de Hongos Los ejemplares de hongos macroscópicos son colectados mediante captura manual en búsqueda activa. Muestreo de Anfibios y Reptiles Se implementó la metodología de inspección por encuentro visual con captura manual (VES) para detectar y capturar anfibios y reptiles. Los muestreos fueron desarrollados durante periodos diurnos (13:00–18:00) y nocturnos (20:00–02:00), y a lo largo de cada transecto fueron evaluados diferentes microhábitats disponibles en cada cobertura (e.g. colchón de hojarasca, alrededor de troncos caídos y piedras, ramas, troncos de árboles, orilla e interior de cuerpos de agua, etc.) buscando eliminar el efecto sobre la detectabilidad causado por la especialización de las diferentes especies. Cada individuo encontrado a lo largo de los muestreos fue considerado como una observación independiente, y al momento de su registro se realizó una descripción detallada de la cobertura donde fue encontrado, microhábitat, cercanía a cuerpos de agua, altura de la percha, tipo de sustrato, sexo, clase de edad, fecha, hora, coordenadas geográficas y altura sobre el nivel del mar. Adicionalmente, fueron tomados todos los datos relevantes relacionados con la historia natural (e.g. canto, reproducción, dieta, etc.) de cada individuo al momento de la observación. Muestreo de Mamíferos Mamíferos pequeños voladores: El muestreo de murciélagos se realizó a través de la instalación de mínimo tres redes de niebla por noche, dispuestas en uno o dos transectos de separación promedio de 20 m entre una y otra. Las redes fueron dispuestas en sitios representativos según la topografía y vegetación del sitio de muestreo y la captura se inició durante la actividad de forrajeo de los murciélagos entre las 17:30 y 18:00 horas para capturar especies de actividad vespertina. Mamíferos pequeños no voladores: Para el muestreo de mamíferos pequeños no voladores se usaron trampas Tomahawk (145x145x410 mm), trampas Sherman (80x90x228 mm) y trampas Victor o ratoneras. Las trampas se ubicaron (a una distancia mínima de 10-15 metros entre cada trampa) pensando en aquellos sitios por donde creemos que podrían pasar estos animales, por lo que se situaron cerca o al lado de cuerpos de agua, en el suelo del bosque donde se veían caminos, al lado del sendero y en cruzaderos como troncos que atraviesan de un lado a otro ya sea un río, el sendero o el mismo bosque. Además, se pusieron trampas altas o de dosel, a 5-7 metros de altura, para intentar capturar aquellos mamíferos arborícolas. Todos los días en la mañana se revisaron y se recebaron las trampas una por una, para verificar si había caído algún animal y para cambiarles el cebo (hecho con avena en hojuelas, mantequilla de maní y esencia de vainilla o de banano), debido a que este se lo pueden comer las hormigas u otros animales, lavarse con la lluvia o perder el olor. Los animales capturados se guardaban en bolsas de tela (100% algodón). Mamíferos medianos y grandes: Los registros de grandes mamíferos como carnívoros se obtuvieron de huellas, heces, huesos y pelos. Muestreo de Insectos Los especímenes de Hemíptera fueron colectados a través de colecta directa, realizando búsquedas activas sobre troncos, hojas, hojarascas en recorridos de dos horas cada 10 horas durante dos meses. Los especímenes del orden Díptera fueron montados sobre placas en bálsamo de Canadá.

Method steps

1. Conservación de Hongos Las muestras son transportadas en recipientes de plástico estéril y mantenidos a temperatura ambiente hasta su procesamiento. Para el aislamiento a partir de la muestra del hongo macroscópico, se toman pequeños fragmentos del cuerpo de fructificación con bisturí estéril y se colocan en cajas Petri en medio sólido (PDA) con antibiótico y se incuban a 30 °C. Se realizan subcultivos periódicos en placas de PDA hasta obtener el aislamiento puro. El cuerpo fructífero se envia al departamento de micología de la Universidad de Antioquia para su clasificación.
2. Conservación de Anfibios y Reptiles Para cada individuo se registra el sexo, la clase de edad, la fecha, la hora, las coordenadas geográficas y la altitud, así como una descripción de la cobertura vegetal y el microhábitat donde se encontró. Los individuos capturados son llevados en bolsas Ziplock (anfibios) y bolsas de tela (reptiles) a un ambiente controlado donde son fotografiados y sacrificados siguiendo la legislación colombiana para el manejo de fauna silvestre (Ley 84 de 1989-Capítulo V; Decreto 1076 de 2015). Se mide cada espécimen, se describe detalladamente todos los caracteres taxonómicamente informativos (por ejemplo, almohadillas digitales, membranas interdigitales, forma de la pupila, escamas, coloración, proporciones corporales) y se recoge una muestra de tejido (hígado o músculo) que se conserva en etanol al 99%. Todos los especímenes se fijan en cámaras herméticas con una solución de formalina tamponada al 10% durante dos o tres días hasta que se transfirieren a etanol al 75%. La identificación taxonómica de anfibios se apoya en la utilización de los textos de Cochran & Goin (1970), Duellman (2001), Savage (2002) y los artículos científicos de Heyer (2005) y Lynch & Rueda-A. (1998, 1999). Para Reptiles se usan los textos Ayala & Castro (Sin Publicar), Campbell & Lamar (2004), Perez-S. & Moreno (1988), Peters & Orejas-M. (1970) y Savage (2002) y los artículos científicos de Ayala & Castro (1983), Harris (1994), Moreno-A. &, Quintero-C. (2015), y Romero-M. et al. (2008). El arreglo taxonómico y sistemático para anfibios empleado en el presente estudio sigue a Frost (2021), mientras que para lagartos, cocodrilos y tortugas sigue a Uetz (2020), y para serpientes a Wallach et al. (2015).
3. Conservación de mamíferos: Los especímenes de mamíferos pequeños no voladores, pequeños voladores y medianos y grandes son sacrificados siguiendo las pautas éticas de la Sociedad Americana de Mastozoólogos, a cada individuo se le toman las medidas biométricas estándar: largo total (LT), largo cola (LC), largo pata (LP), largo oreja (LO) y largo del antebrazo (LA), como también el registro del sexo y la condición reproductiva. Los individuos colectados son preparados como especímenes de museo en piel seca y en líquido. A cada individuo se le extrajo una muestra de tejido hepático preservada en el campo en etanol al 99% y posteriormente preservada a –20º C. Para la extracción del tejido se siguió la guía de recolección de tejidos biológicos para análisis genéticos del Instituto Alexander von Humboldt. Identificación y descripción morfológica y morfométrica: Para la identificación y la descripción morfológica de los individuos de las distintas especies se usan las guías taxonómicas de Gardner (2008), York et al. (2019) y Diaz et al. (2021), también se revisan las descripciones originales de algunas especies y las descripciones mencionadas en la bibliografía especializada en taxonomía y sistemática de los géneros y especies evaluadas.
4. Conservación de Insectos Los especímenes de Hemíptera son preservados en etanol al 75% para evitar la contaminación bacteriana y fúngica. Los especímenes del orden Díptera son montados sobre placas en bálsamo de Canadá.

La Colección Biológica Universidad EAFIT custodia especímenes de vertebrados, invertebrados (macroorganismos) y hongos (microorganismos). 1. Macroorganismos -De mamíferos custodia principalmente ejemplares de los órdenes Rodentia, Chiroptera, Carnívora, Didelphimorphia, Eulipotyphla, Eulipotyphla y Paucituberculata. -De anfibios custodia ejemplares de los órdenes Anura, Caudata y Gymnophiona. -De reptiles custodia ejemplares de los órdenes Crocodylia, Squamata y Testudines. -De invertebrados custodias principalmente ejemplares del orden Díptera y Hemíptera. 2. Microorganismos -Custodias ejemplares de los filo de hongos Ascomycota y Basidiomycota.

1. Ascomycota
   common name: Hongos rank: phylum
2. Basidiomycota
   common name: Hongos rank: phylum
3. Anura
   common name: Ranas y Sapos rank: order
4. Caudata
   common name: Salamandras rank: order
5. Gymnophiona
   common name: Cecilias rank: order
6. Crocodylia
   common name: Cocodrilos rank: order
7. Squamata
   common name: Lagartos y Serpientes rank: order
8. Testudines
   common name: Tortugas rank: order
9. Rodentia
   common name: Roedores rank: order
10. Chiroptera
    common name: Murciélagos rank: order
11. Carnivora
    common name: Mamíferos placentarios carnivoros rank: order
12. Didelphimorphia
    common name: Chuchas y Zarigüeyas rank: order
13. Eulipotyphla
    common name: Musarañas rank: order
14. Lagomorpha
    common name: Conejos y Liebres rank: order
15. Paucituberculata
    common name: Ratones runchos rank: order
16. Diptera
    common name: Moscas rank: order
17. Hemiptera
    common name: Chinches y Cigarras rank: order

La Colección Biológica Universidad EAFIT custodia especímenes de 33 municipios en ocho de los 32 municipios de Colombia: Antioquia, Caldas, Chocó, Córdoba, Cundinamarca, La Guajira, Quindío y Risaralda