Registros de Cacao y microorganismos aislados asociados al proyecto: Evaluación de fermentación de Cacaos criollos especiales en el Pacífico colombiano

Study Extent

Cultivos de cacao en Tuluá, Valle del Cauca.

Sampling

Colecta manual de muestras. Las muestras se transfirieron individualmente a bolsas estériles. Todas las colectas se marcaron con número consecutivo y su ubicación geográfica y fueron posteriormente almacenadas a -20°C. No se depositaron en ninguna colección.

Quality Control

Se estructuraron los datos biológicos en Darwin Core (DwC) como registros biológicos, mediante el uso de los elementos, definiciones y vocabularios controlados del estándar. Adicionalmente, durante las fases de validación y limpieza se compararon los datos con referentes internacionales y nacionales y se utilizaron diferentes rutinas diseñadas por el SiB Colombia que permitieron comparar la información biológica de los registros con el árbol taxonómico de GBIF y a partir de las sugerencias traídas, completar la información de algunos campos. También se uso la herramienta TNRS por sus siglas en inglés (Taxonomic Name Resolution Service) desarrollada por iPlant cuyas fuentes taxonómicas son TROPICOS, TPL, Y USDA; por otro lado, la información de las entidades político/administrativas se valido con la DIVIPOLA de Colombia y haciendo uso del software QGiS se valido la georreferenciación de las coordenadas a partir de un análisis de intersección de los puntos con las entidades geográficas; El formato de fecha se valido de acuerdo a ISO 8601.

Method steps

1. Se realizó un muestreo aleatorio al interior de la finca de caco, colectando manualmente las muestras seleccionadas. Estas fueron posteriormente transferidas a bolsas estériles individuales.
2. Todas las colectas se marcaron con número consecutivo y su ubicación geográfica. Después de la recolección las muestras fueron trasladadas al laboratorio de Investigaciones de la Universidad de San Buenaventura Cali, donde se almacenaron en nevera a -20°C.
3. Se realizo la identificación molecular de los microorganismos aislados.

8 registros de Theobroma subincanum (planta de cacao).

1. Theobroma subincanum
   common name: Cacao rank: species

57 registros de los microorganismos aislados que corresponden a 2 subespecies, 19 especies y 16 géneros agrupados en los phylum Proteobacteria, Firmicutes, Ascomycota y Actinobacteriota, correspondientes a 8 familias, siendo Enterobacteriaceae, Bacillaceae y Acetobacteraceae las que agrupan más registros con 15, 12 y 11 respectivamente.

1. Acetobacteraceae
   rank: family
2. Bacillaceae
   rank: family
3. Enterobacteriaceae
   rank: family
4. Lactobacillaceae
   rank: family
5. Microbacteriaceae
   rank: family
6. Paenibacillaceae
   rank: family
7. Pichiaceae
   rank: family
8. Staphylococcaceae
   rank: family

Finca Villa Gladis, Tres esquinas Tuluá, departamento del Valle del Cauca.