Anfibios y Reptiles del Centro Universitario Regional Noreste (UdelaR)

Study Extent

El conjunto de datos incluye 697 especímenes colectados en localidades de Uruguay en el estado de Rio Grande do Sul en Brasil, en el período entre enero de 2009 y diciembre de 2019.

Sampling

Los registros son especímenes recolectados mediante diferentes técnicas como captura manual y trampas de caída, que luego fueron fijados en formol y preservados en etanol 70%. La gran mayoría de las georeferencias provienen de coordenadas geográficas tomadas mediante GPS, y secundariamente, mediante localización de puntos de muestreo en Google Earth. También en la mayoría de los casos los registros corresponden a campañas de muestreo para tesis y pasantías de investigación de grado y posgrado.

Quality Control

Se chequearon errores en los nombres científicos, localización geográfica y fechas. Se agregaron datos sobre la autoría de los nombres científicos de las especies y se completaron los rangos taxonómicos desde Reino hasta el rango infraespecífico, se incluyó el término de rango taxonómico según el nivel de detalle de la especie. Se asignó a cada registro el nivel administrativo de Estado/Provincia y se incorporaron datos sobre la incertidumbre y precisión de la localización geográfica. El código de R utilizado para la limpieza de datos está disponible en nuestro repositorio de GitHub (https://github.com/bienflorencia/rBiodiversidata).

Method steps

1. Chequeo de nombres científicos. Verificación de errores ortográficos en los nombres científicos usando los paquetes de R 'taxize' (Chamberlain et al. 2020) y actualización de nombres científicos de acuerdo a Amphibian Species of the World (Frost 2021). El nombre original de la especie se mantuvo bajo el término "previousIdentifications".
2. Recuperación completa de rangos taxonómicos superiores, inclusión del término de rango infraespecífico y la autoridad taxonómica para los nombres científicos.
3. Verificación de errores o valores atípicos o inexactos en la localización geográfica. Incorporación de los campos de incertidumbre y precisión para los valores de latitud y longitud proporcionados.
4. Identificación del estado/provincia geográfica a través de la base de datos del GeoNames Gazetteer utilizando el paquete R 'geonames' (Rowlingson 2019). Inclusión de términos estándares para los rangos geográficos más altos que el nivel de localidad (continente y país).

El conjunto de datos reune un total de 32 especies de anfibios (6 familias) y 20 especies de reptiles (11 familias).

1. Amphibia
   common name: Anfibios rank: class
2. Reptilia
   common name: Reptiles rank: class
3. Alsodidae
   rank: family
4. Bufonidae
   rank: family
5. Hylidae
   rank: family
6. Leptodactylidae
   rank: family
7. Microhylidae
   rank: family
8. Odontophrynidae
   rank: family
9. Amphisbaenidae
   rank: family
10. Colubridae
    rank: family
11. Diploglossidae
    rank: family
12. Dipsadidae
    rank: family
13. Gekkonidae
    rank: family
14. Gymnophthalmidae
    rank: family
15. Leptotyphlopidae
    rank: family
16. Phyllodactylidae
    rank: family
17. Teiidae
    rank: family
18. Tropiduridae
    rank: family
19. Viperidae
    rank: family

Los datos tienen una cobertura geográfica que incluye 171 localidades de 16 departamentos de Uruguay y 4 localidades del estado de Rio Grande do Sul en Brasil.