Colección de microorganismos con interés en nutrición animal

Juan Camilo Ovalle Masmela; Lina Marcela Botero Rute; Fernando Rodriguez Villamizar; Rocio Fenney Herrera León; Hugo Rodolfo Jimenez Sabogal

doi:10.15472/dpbwjh

Colección de microorganismos con interés en nutrición animal

Citation

Ovalle Masmela J C, Botero Rute L M, Rodriguez Villamizar F, Herrera León R F, Jimenez Sabogal H R (2024). Colección de microorganismos con interés en nutrición animal. Version 1.6. Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA. Occurrence dataset https://doi.org/10.15472/dpbwjh accessed via GBIF.org on 2024-11-08.

Description

La colección de microorganismos con interés en nutrición animal (CMINA) hace parte de las colecciones que conforman el banco de microorganismos de la nación colombiana custodiado por AGROSAVIA. La colección CMINA se encuentra conservada principalmente bajo un sistema de criopreservación en nitrógeno líquido a -196ºC y ultra frío a -80ºC, manteniendo la viabilidad de las accesiones además de la capacidad para ser reactivados muchos años después, para su estudio y uso en investigación.

Esta colección esta conformada por dos grandes grupos de microorganismos. El primer grupo, corresponde a bacterias aisladas del tracto gastrointestinal de herbívoros silvestres y el segundo, por bacterias ácido-lácticas provenientes de ensilajes. Por sus características el primer grupo son microorganismos anaerobios estrictos, en su mayoría con potencial celulítico. El grupo de bacterias Ácidolácticas son bacterias Gram positivas, catalasa negativo y en su mayoría con potencial biocontrolador y probiótico.

Este recurso contiene la información de 191 microorganismos actualmente presentes en la colección y de 145 que han sido dados de baja, estos datos han sido tomados entre 1996 al 2022 en 10 departamentos de Colombia.

Ademas contiene información de la actividad antagónica contra algunas bacterias en el campo dynamicProperties. Adicionalmente, en las extensiones contiene información del medio de cultivo, métodos de preservación y datos de primers para la amplificación.

Purpose

https://ipt.biodiversidad.co/sib/manage/metadata-additional.do?r=agrosavia_microorganismos_interes_nutricional

Sampling Description

Study Extent

La muestras han sido tomadas a hospederos (Mamíferos y plantas) en 10 departamentos del país.

Sampling

Los muestreos se realizaron a bovinos de razas criollas para el aislamiento de microorganismos provenientes del rumen. Adicionalmente se realizaron muestreos de ensilajes de avena y maíz del altiplano cundiboyacense para la obtención de bacterias Ácidolácticas

Method steps

Para microorganismos del rumen: 1.Obtención de fluido ruminal por sonda orofaringea, 2.Inoculación y transporte de medios inoculados a una temperatura de 30°C, 3.Repique en medio de cultivo selectivo para aislamiento
Para Bacterias Ácidolácticas: 1.Obtención de muestras de ensilaje de avena y maíz recién abierto, 2.Embalaje y transporte de muestras en condiciones de refrigeración

Taxonomic Coverages

Este recurso contiene 336 registros de Bacterias, pertenecientes a 4 filos, 5 clases, 6 ordenes, 13 familias y 22 géneros. Un 73% esta clasificado a especie, 14% a reino y 13% a género.

Bacillaceae
rank: family
Carnobacteriaceae
rank: family
Clostridiaceae
rank: family
Enterobacteriaceae
rank: family
Enterococcaceae
rank: family
Fibrobacteraceae
rank: family
Lachnospiraceae
rank: family
Lactobacillaceae
rank: family
Paenibacillaceae
rank: family
Ruminococcaceae
rank: family
Staphylococcaceae
rank: family
Streptococcaceae
rank: family
Veillonellaceae
rank: family

Geographic Coverages

Las muestras han sido recolectadas en todo el territorio nacional, abarcando 10 departamentos, en los que se encuentra: Antioquia, Boyacá, Caquetá, Casanare, Córdoba, Cundinamarca, Magdalena, Meta, Tolima y Valle del Cauca.

Bibliographic Citations

Contacts

Juan Camilo Ovalle Masmela
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Lina Marcela Botero Rute
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Hugo Rodolfo Jimenez Sabogal
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Hugo Rodolfo Jimenez Sabogal
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