Red Book of Mammals in Portugal (part II)
Citation
Grilo C, Negrões N, Barros P, Medinas D, Afonso B C (2023). Red Book of Mammals in Portugal (part II). Version 1.4. ICNF - Instituto da Conservação da Natureza e das Florestas. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/e6ttpm accessed via GBIF.org on 2024-10-05.Description
Red Book of Mammals in Portugal (part II) is a publicly available data set with the compilation of two types of data: 1) published data (e.g. Bencatel et al. (2017), free and open access biodiversity data online platforms and unpublished geo-referenced occurrence shared by public institutions such as wildlife recovery centers, citizen and science and Natural museums); 2) data from field surveys carried out by teams from University of UTAD, Porto, Aveiro and Évora teams under the POSEUR project. This data set comprises 242289 records of terrestrial, volant and marine mammals in mainland Portugal and archipelagos of Azores and Madeira that went through a validation process by experts.Sampling Description
Study Extent
The geographic scope of this study focuses on mainland Portugal and archipelagos of Azores and Madeira between 1989 and 2021.Sampling
Published data lacks information on the sampling methods. The great majority of data is from specimens provided by the institutions, citizens (https://livrovermelhodosmamiferos.pt/colabore) or from the Atlas of Mammals in Portugal (Bencatel et al. 2017). Data from field surveys were obtained through the following sampling methods: captures, transects, hair trapping, photo-trapping, predator diet (pellets), echolocation, direct observations. More than 100 records were confirmed by genetics.Quality Control
All initial data was inserted in a specific database built for the project. In the preparation of the dataset for GBIF publication, data consistency was verified using cluster algorithms using OpenRefine.Method steps
- Published Data: The present data were obtained mammals records provided by the following sources: Atlas of Mammals in Portugal (Bencatel et al. 2017), RIAS - Centro de Recuperação e Investigação de Animais Selvagens, CERVAS - Centro de Ecologia, Recuperação e Vigilância de Animais Selvagens, Fciencias.ID (https://livrovermelhodosmamiferos.pt/colabore), Biodiversity4All (https://www.biodiversity4all.org/), iNaturalist (https://www.inaturalist.org), GBIF (https://www.gbif.org/), Obis (https://obis.org) Natural Museums in Porto (MHNC-UP), Coimbra (MCUC), and Lisbon (MNHNAC), ICNF (reports from captures license).
- Some data location was provided at municipality (concelho) and locality (freguesia). For that information we used the geolocate data and add the coordinateUncertaintyInMeters 10,000m for concelho and 3,000 for freguesia.
- The column of the authors of the records (recordedBy) was placed in DwC format with the name of the authors separated by “|”.
- All rows had dates, so the separation into day, month, year was made and then theeventDate column was created with the date in ISO format. Date consistency was checked and when there was information on the date, we assigned the year.
- Duplicates have been removed using eventDate, scientificName, verbatimCoordinates,and associatedReferences columns and materialSampleID.
- Data from field surveys: The present data are a compilation of the data sets provided by the final reports: Pita et al. (2021) Fonseca et al. (2021), Consórcio Consultoria Científica Chiroptera (2021). The column of the authors of the records (recordedBy) was placed in DwC format with the name of the authors separated by “|”. All rows had dates, so the separation into day, month, year was made and then the eventDate column was created with the date in ISO format. Date consistency was checked and when there was information on the date we assigned the year.
Taxonomic Coverages
This dataset includes 242289 records referring to specimens of 6 orders, 9 different families, and 109 species
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Animaliarank: kingdom
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Chordatarank: phylum
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Mammaliarank: class
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Carnivorarank: order
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Rodentiarank: order
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Lagomorpharank: order
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Chiropterarank: order
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Eulipotyphlarank: order
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Cetartiodactylarank: order
Geographic Coverages
The occurrences are in mainland Portugal and archipelagos of Azores and Madeira.
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