Santander Bio: Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA)
Citation
Fuentes Lorenzo J L, Suescun Sepulveda J A (2021). Santander Bio: Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA). Version 1.2. Universidad Industrial de Santander. Occurrence dataset https://doi.org/10.15472/5nv2wo accessed via GBIF.org on 2024-08-24.Description
La colección de microorganismos del proyecto Santander Bio, tiene su origen de la actividad de recolección de diversas muestras (agua, sedimentos, biopelículas de estratos asociados) obtenidas en diferentes cuerpos de agua dulce, cavernas y termiteros del Departamento de Santander (Colombia).
En total, el 43.5 % de los especímenes de la colección se encuentran identificados a nivel de género y el 56.57 % de los especímenes a nivel de reino.
Purpose
Soportar la actividad académica en el área de Microbiología y potenciar la investigación de los programas de pregrado y posgrado de la Escuela de Biología en el área de Microbiología con énfasis en Taxonomía Microbiana, Geo-Microbiología, Microbiología Ambiental, Industrial y Biomédicas.Sampling Description
Study Extent
El área de muestreo es el departamento de Santander, Colombia e incluye diversas muestras (agua, sedimentos, biopelículas de estratos asociados) obtenidas en diferentes cuerpos de agua dulce, cavernas y termiteros del Departamento de Santander (Colombia).Sampling
El muestreo es realizado de forma aséptica, tomando una alícuota del hábitat a estudiar (lodo, agua, biofilm, termiteros), junto con sus variables fisicoquímicas (pH, temperatura, entre otras).Quality Control
El procesamiento de la muestras se debe realizar antes de las 72 horas, manteniendo la muestra en refrigeración. Ajuste de vocabularios controlados en: Elementos de registros: collectionID y type de acuerdo a la naturaleza de los datos; Elemento temporal: eventDate.Method steps
- Toma de muestras asépticamente, empleando material estéril para la toma de muestra, variando entre los instrumentos
- Enriquecimiento de la muestra empleando distintos tipos de cultivo enriquecido en los que se incluyen: medio mínimo de sales, medio mínimo de sales con distintos suplementos (extracto de levadura, glucosa, glicerol, manitol), medio reforzado para clostridiales, BG11, caldo nutritivo, DSMZ, entre otros. El crecimiento en medio enriquecido se realiza por un periodo máximo de un mes, a la temperatura del sitio de aislamiento o a 37 °C.
- Aislamiento de microorganismos empleando diluciones seriadas y siembra por extensión empleando asas de Drigalsky sobre medio sólido, de la misma composición del medio enriquecido, con el fin de obtener colonias aisladas con diferentes características tíntoriales y culturales.
- Conservación a través de criopreservación empleando zeolita y glicerol al 30 % para bacterias y levaduras. Para los hongos filamentosos se realiza crecimiento sobre papel filtro hasta su esporulación, posterior a ello se deseca el papel filtro con el hongo y se criopreserva.
- Identificación de los aislados secuenciando el gen 16S rRNA para las bacterias y el 18S rRNA para los hongos filamentosos y levaduriformes.
Taxonomic Coverages
En total, el 43.5 % de los especímenes de la colección Santander Bio se encuentran identificados a nivel de género y el 56.57 % de los especímenes a nivel de reino.
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Actinobacteriarank: phylum
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Firmicutesrank: phylum
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Proteobacteriarank: phylum
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Ascomycotarank: phylum
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Basidiomycotarank: phylum
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Bacteroidetesrank: phylum
Geographic Coverages
Los aislados microbianos fueron obtenidos de obtenidos de diferentes cuerpos de agua dulce y sustratos asociados del Departamento de Santander.
Bibliographic Citations
Contacts
Jorge Luis Fuentes Lorenzooriginator
position: Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Cra 27, Calle 9na
Bucaramanga
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email: jfuentes@uis.edu.co
Jhon Alexander Suescun Sepulveda
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position: Auxiliar de curación
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Jorge Luis Fuentes Lorenzo
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Jhon Alexander Suescun Sepulveda
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Jorge Luis Fuentes
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