Código de barras genético de especies de anfibios y reptiles de México

Virginia León Régagnon

doi:10.15468/ljtlnc

Código de barras genético de especies de anfibios y reptiles de México

Citation

León Régagnon V, Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad C (2024). Código de barras genético de especies de anfibios y reptiles de México. Version 1.16. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/ljtlnc accessed via GBIF.org on 2024-11-03.

Description

El desarrollo del presente proyecto sentará las bases para la creación de una base de datos de secuencias de ADN de referencia, asociadas a la información taxonómica de cada especie de anfibios y reptiles en México. Esta base de datos servirá en un futuro cercano como un sistema de identificación rápida de especies. De esta manera, se abrirá al fin una vía de comunicación ágil entre los generadores de información taxonómica y los usuarios de ésta (ecólogos, conservacionistas, ecoguardias, etc.), poniendo a su alcance información valiosa en la planeación de planes de manejo y conservación. El objetivo general del presente proyecto es caracterizar genéticamente a especies selectas de anfibios y reptiles en México, con secuencias del gen Citocromo Oxidasa I (COI) para generar una herramienta de identificación rápida de dichas especies. Se obtendrán las secuencias parciales del gen COI para 108 especies de anfibios y reptiles de México, amenazadas y/o con problemas taxonómicos. En los casos necesarios se obtendrán las secuencias de otras regiones de ADN para lograr la diferenciación de las especies. Las secuencias se analizarán con metodologías de agrupación filogenética como parsimonia o análisis bayesianos. La información taxonómica, geográfica, la secuencia de COI, la fotografía de los ejemplares, y otras secuencias si es el caso se incorporarán al sistema BOLD (www.boldsystem.org).

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 2 Orden: 3 Familia: 14 Género: 36 Especie: 104 Epitetoinfraespecifico: 4

Taxonomic Coverages

Reino: Animalia Filo: Chordata Clase: Amphibia, Reptilia Orden: Anura, Squamata, Testudines Familia: Ranidae, Craugastoridae, Microhylidae, Bufonidae, Anguidae, Dipsadidae, Colubridae, Phrynosomatidae, Leptodactylidae, Natricidae, Hylidae, Iguanidae, Leptotyphlopidae, Kinosternidae

Animalia
rank: kingdom
Chordata
rank: phylum
Amphibia
rank: class
Reptilia
rank: class
Anura
rank: order
Squamata
rank: order
Testudines
rank: order
Ranidae
rank: family
Craugastoridae
rank: family
Microhylidae
rank: family
Bufonidae
rank: family
Anguidae
rank: family
Dipsadidae
rank: family
Colubridae
rank: family
Phrynosomatidae
rank: family
Leptodactylidae
rank: family
Natricidae
rank: family
Hylidae
rank: family
Iguanidae
rank: family
Leptotyphlopidae
rank: family
Kinosternidae
rank: family
Lithobates
rank: genus
Craugastor
rank: genus
Gastrophryne
rank: genus
Incilius
rank: genus
Mesaspis
rank: genus
Imantodes
rank: genus
Leptophis
rank: genus
Sceloporus
rank: genus
Leptodactylus
rank: genus
Thamnophis
rank: genus
Smilisca
rank: genus
Dendropsophus
rank: genus
Geophis
rank: genus
Conophis
rank: genus
Ctenosaura
rank: genus
Rhinella
rank: genus
Agalychnis
rank: genus
Abronia
rank: genus
Leptodeira
rank: genus
Tlalocohyla
rank: genus
Hypopachus
rank: genus
Diaglena
rank: genus
Hyla
rank: genus
Anaxyrus
rank: genus
Ficimia
rank: genus
Exerodonta
rank: genus
Gerrhonotus
rank: genus
Leptotyphlops
rank: genus
Pituophis
rank: genus
Charadrahyla
rank: genus
Plectrohyla
rank: genus
Kinosternon
rank: genus
Ecnomiohyla
rank: genus
Lampropeltis
rank: genus
Pseudelaphe
rank: genus
Bufo
rank: genus
Lithobates forreri
common name: otác (Seri), rana, rana de Forrer, rana del zacate, rana leopardo de Forrer, rana leopardo del zacate, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
Lithobates brownorum
common name: rana de Brown, rana leopardo de Brown, x-túuts´ (Maya) rank: species
Craugastor rupinius
common name: rana de arroyo escarpado rank: species
Gastrophryne olivacea
common name: rana pajarito, ranita olivo, sapo boca angosta oliváceo rank: species
Incilius mazatlanensis
common name: sapito de Mazatlán, sapito pinto de Mazatlán, sapo pinto, sapo sinaloense rank: species
Mesaspis gadovii
rank: species
Imantodes cenchoa
common name: cordelilla manchada, culebra cordelilla chata rank: species
Leptophis diplotropis
common name: culebra perico, culebra perico gargantilla, culebra verde, güirotillera, ranera del litoral del Pacífico, ranera verde rank: species
Sceloporus horridus
common name: chintete escamoso, lagartija, lagartija escamosa tarasca, lagartija espinosa del pacífico, torosco rank: species
Sceloporus internasalis
common name: lagartija escamosa verde, lagartija espinosa verde rank: species
Sceloporus variabilis
common name: lagartija escamosa panza rosada, lagartija espinosa panza rosada rank: species
Lithobates montezumae
common name: rana de Moctezuma, rana leopardo de Moctezuma rank: species
Craugastor tarahumaraensis
common name: otác (Seri), rana ladradora tarahumara, rana ladrona amarilla, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
Lithobates omiltemanus
common name: rana guerrerense, rana leopardo de Guerrero, rana leopardo de Omilteme rank: species
Leptodactylus melanonotus
common name: múuch (Maya), otác (Seri), rana del sabinal, rana nidificadora de sabinal, ranita espumera de dedos marginados, ranita hojarasca, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
Mesaspis moreletii
common name: lagarto escorpión, lagarto escorpión de Morelet, lagarto escorpión sureño rank: species
Thamnophis mysocephalus
rank: species
Thamnophis proximus
common name: culebra acuática, culebra listonada occidental rank: species
Mesaspis viridiflava
common name: lagarto escorpión enano rank: species
Smilisca baudinii
common name: otác (Seri), quech (Maya), rana arborícola mexicana, rana arbórea de Baudin, rana de árbol mexicana, rana de árbol mexicana común, rana trepadora, x-túuts´ (Maya), ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
Incilius nebulifer
common name: sapo nebuloso rank: species
Dendropsophus microcephalus
common name: quech (Maya), rana arborícola grillo amarilla, rana de árbol amarilla, rana grillo, ranita amarilla, ranita arborícola, x-túuts´ (Maya) rank: species
Craugastor pygmaeus
common name: rana ladradora pigmea, rana ladrona pigmea, rana pigmea de dedos libres, rana pygmea ladradora rank: species
Geophis semidoliatus
common name: coralillo falso, culebra minadora coralillo, minadora coralilla rank: species
Lithobates psilonota
common name: rana espalda lisa rank: species
Conophis vittatus
common name: culebra guardacaminos rayada, culebra mexicana de dos líneas rank: species
Ctenosaura similis
common name: iguana espinosa rayada, iguana negra, iguana negra de cola espinosa rank: species
Rhinella horribilis
common name: bezmuch (Maya), sapo común, sapo gigante, sapo grande, sapo lechero, sapo verrugoso, totmuch (Maya) rank: species
Lithobates sierramadrensis
common name: rana Sierra Madre, rana de la Sierra Madre Occidental rank: species
Agalychnis dacnicolor
common name: otác (Seri), rana cara de niño, rana verde, ranita verduzca, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
Abronia oaxacae
common name: escorpión arborícola de Oaxaca, lagarto alicante oaxaqueño rank: species
Lithobates spectabilis
common name: rana manchada, rana vistosa rank: species
Lithobates vaillanti
common name: rana, rana de Vaillant, rana verde rank: species
Mesaspis juarezi
common name: lagarto escorpión de Sierra de Juárez rank: species
Abronia graminea
common name: escorpión arborícola de Tehuacán, lagarto alicante terrestre rank: species
Craugastor rhodopis
common name: rana de hojarasca, rana de selva, rana hojarasquera común, rana ladradora polimorfa, rana ladrona polimorfa rank: species
Geophis laticinctus
common name: culebra minera de la Mesa Central, minadora de la meseta central rank: species
Geophis dubius
common name: culebra minera de la Mesa del Sur, minadora de la meseta del sur rank: species
Sceloporus mucronatus
common name: chintete, chintete de grieta meridonial, lagartija escamosa de grieta sureña rank: species
Leptodeira septentrionalis subsp. polysticta
common name: culebra ojo de gato rank: species
Lithobates neovolcanicus
common name: rana leopardo neovolcánica, rana neovolcánica rank: species
Tlalocohyla smithii
common name: otác (Seri), rana de árbol mexicana, rana de árbol mexicana enana, ranita enana mexicana, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
Hypopachus variolosus
common name: chacmuch (Maya), múuch (Maya), otác (Seri), rana manglera, rana oveja común, rana ovejera, rana termitera, termitero balador, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
Thamnophis godmani
common name: culebra listonada, culebra listonada de Godman, culebra rayada, víbora de agua, víbora rayada rank: species
Diaglena spatulata
common name: rana de árbol cabeza de pala, rana pico de pato, rana pico de pato del pacífico, ranita de cabeza espatulada rank: species
Leptophis mexicanus
common name: culebra perico mexicana, ranera mexicana rank: species
Sceloporus siniferus
common name: lagartija escamosa cola larga, lagartija escamoso castaño, lagartija espinosa de cola larga rank: species
Abronia taeniata
common name: escorpión arborícola de bandas, lagarto alicante de bromelia rank: species
Hyla eximia
common name: rana de árbol de montaña, rana verde manchada, ranita de montaña rank: species
Dendropsophus sartori
common name: rana de árbol, rana de árbol de Taylor, ranita amarilla de Taylor, ranita rayada rank: species
Anaxyrus kelloggi
common name: sapito, sapito mexicano, sapo mexicano, sapo pequeño mexicano rank: species
Mesaspis antauges
common name: lagartija lagarto del Pico de Orizaba, lagarto escorpión de Monte Orizaba rank: species
Geophis mutitorques
common name: culebra minera de tierras altas, minadora de tierras altas rank: species
Incilius marmoreus
common name: sapo jaspeado, sapo marmoleado rank: species
Thamnophis melanogaster
common name: culebra de agua, culebra de agua de panza negra, culebra de agua de panza negra mexicana, culebra negra en Aguascalientes, víbora de agua rank: species
Lithobates magnaocularis
common name: otác (Seri), rana del noroeste mexicano, rana leopardo del noreste, rana leopardo del noreste de México, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
Incilius valliceps
common name: múuch (Maya), sapo, sapo común, sapo costero, sapo del golfo rank: species
Sceloporus formosus
common name: chintete esmeralda, lagartija escamosa esmeralda norteña, lagartija espinosa esmeralda norteña rank: species
Lithobates berlandieri
common name: otác (Seri), rana leopardo, rana leopardo del río Bravo, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
Craugastor hobartsmithi
common name: rana ladradora de Smith, rana ladradora pigmea, rana ladrona pigmeo de Smith rank: species
Thamnophis chrysocephalus
common name: culebra de agua nómada cabeza dorada, culebra listonada cabeza dorada rank: species
Leptodeira maculata
common name: culebra ojo de gato del suroeste, escombreara del suroeste mexicano rank: species
Ficimia publia
common name: culebra naricilla manchada rank: species
Exerodonta smaragdina
common name: rana de árbol esmeralda, ranita de pastizal, ranita esmeralda rank: species
Gerrhonotus liocephalus
common name: lagartija lagarto sureña, lagarto escorpión texano rank: species
Leptodeira septentrionalis
common name: culebra ojo de gato norteña, escombrera manchada rank: species
Leptodeira splendida
common name: culebra ojo de gato espléndida, escombrera ojo de gato rank: species
Lithobates zweifeli
common name: rana de Zweifel rank: species
Leptotyphlops goudotii
rank: species
Craugastor mexicanus
common name: rana ladradora mexicana, rana ladrona mexicana, ranita de hojarasca rank: species
Pituophis deppei
common name: alicante, cincuate, cincuate mexicana, culebra casera, culebra sorda mexicana, ratonera rank: species
Charadrahyla taeniopus
common name: calate jarocho, rana de árbol jarocha rank: species
Sceloporus grammicus
common name: chintete de mezquite, lagartija escamosa de mezquite, lagartija espinosa del mezquital rank: species
Mesaspis monticola
rank: species
Hyla arenicolor
common name: otác (Seri), rana de árbol color arena, ranita de cañon, ranita de las rocas, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
Abronia fimbriata
rank: species
Plectrohyla cyclada
common name: ranita de borde bronceado rank: species
Abronia martindelcampoi
common name: escorpión arborícola, escorpión arborícola de Martin del Campo rank: species
Incilius perplexus
common name: sapo confuso, sapo de la cuenca del rio Tepalcatepec, sapo perplejo rank: species
Ctenosaura pectinata
common name: iguana de roca, iguana espinosa Mexicana, iguana mexicana de cola espinosa, iguana negra rank: species
Kinosternon leucostomum
common name: abaniquillo de Hidalgo, casquito de labios blancos, pochitoque septentrional, tortuga pecho quebrado labios blancos rank: species
Kinosternon integrum
common name: casquito de burro, tortuga de agua, tortuga de río, tortuga pecho quebrado mexicana rank: species
Geophis sallaei
common name: culebra minadora de Salle, minadora de Sallé rank: species
Exerodonta sumichrasti
common name: rana de árbol, rana de árbol de Sumichrast, ranita de Sumichrast rank: species
Ecnomiohyla miotympanum
common name: calate, calate arborícola, rana de árbol orejas chicas rank: species
Craugastor rugulosus
common name: rana de tierra, rana ladrona centroamericana rank: species
Sceloporus subpictus
common name: lagartija escamosa pintada, lagartija espinosa de panza pinta rank: species
Imantodes gemmistratus
common name: cordelilla de la escamuda, culebra, culebra cordelilla centroamericana rank: species
Abronia campbelli
rank: species
Lampropeltis polyzona
common name: falsa coralillo rank: species
Sceloporus jalapae
common name: chintete, lagartija escamosa jalapeña, lagartija espinosa de Jalapa, lagartija espinosa del Valle de Tehuacán rank: species
Pseudelaphe flavirufa
rank: species
Hyla euphorbiacea
common name: rana de árbol de Los Altos del Sur, ranita de alta montaña rank: species
Leptotyphlops tenuis
rank: species
Pituophis catenifer
common name: burrillo, cincuate, cocasnáacöl (Seri), topera, víbora sorda rank: species
Geophis petersii
common name: culebra minera de Peters, minadora de Peters rank: species
Abronia deppii
common name: escorpión arborícola, escorpión arborícola de Deppe, lagarto alicante rank: species
Kinosternon hirtipes
common name: casquito de pata rugosa, tortuga pecho quebrado pata rugosa rank: species
Thamnophis eques
common name: culebra de agua, culebra de agua nómado mexicano, culebra listonada del sur Mexicano rank: species
Abronia lythrochila
common name: escorpión arborícola de labios rojos, lagarto alicante labios rojos rank: species
Incilius tutelarius
common name: sapo de Chimalapas rank: species
Abronia mixteca
common name: escorpión arborícola mixteco, lagarto alicante mixteco rank: species
Geophis bicolor
common name: culebra minera del Altiplano, minadora de la meseta mexicana rank: species
Abronia frosti
rank: species
Mesaspis moreleti subsp. fulvus
rank: infraspecificname
Mesaspis moreleti subsp. salvadorensis
rank: infraspecificname
Mesaspis moreletii subsp. temporalis
rank: infraspecificname
Mesaspis moreletii subsp. moreletii
rank: infraspecificname

Geographic Coverages

País: COSTA RICA (HEREDIA, SAN JOSE) País: GUATEMALA (ALTA VERAPAZ, HUEHUETENANGO, JALAPA, QUETZALTENANGO, QUICHE, SAN MARCOS) País: HONDURAS (ATLANTIDA, CORTES, FRANCISCO MORAZAN, OCOTEPEQUE) País: MEXICO (CAMPECHE, CHIAPAS, CHIHUAHUA, CIUDAD DE MEXICO, COLIMA, DISTRITO FEDERAL, DURANGO, GUERRERO, HIDALGO, JALISCO, MEXICO, MICHOACAN DE OCAMPO, MORELOS, NAYARIT, OAXACA, PUEBLA, QUERETARO, QUINTANA ROO, SAN LUIS POTOSI, SINALOA, SONORA, TABASCO, TAMAULIPAS, TLAXCALA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, YUCATAN, ZACATECAS) País: NICARAGUA (JINOTEGA)

Bibliographic Citations

Contacts

Virginia León Régagnon
originator
position: Responsable
Universidad Nacional Autónoma de MéxicoInstituto de BiologíaEstación Chamela
Apartado Postal 21
San Patricio Melaque
48980
Jalisco
MX
Telephone: 01 312 3161000 ext. 49003 01 315 35 10200 56229167
email: vleon@ib.unam.mx

CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
metadata author
position: Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
MÉXICO
14010
Tlalpan
MX
Telephone: 50045000
email: patricia.ramos@conabio.gob.mx
homepage: https://www.gob.mx/conabio

Patricia Ramos Rivera
administrative point of contact
position: Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
México
14010
Tlalpan
MX
Telephone: 50045000
email: patricia.ramos@conabio.gob.mx
homepage: https://www.gob.mx/conabio