Colección de Microorganismos Universidad Católica de Manizales

Study Extent

La recolección de la muestra de suelo se realizó en el área verde de la finca "La María" en la vereda la trina de Supia, Caldas, Colombia, con una altura de 1220 msnm, con latitud: 5.4557 y longitud: -75.6569889 La recolección del material vegetal se realizó en las revuelterias de Manizales en los barrios la alta suiza, la enea y malabar. Con latitud: 5.067, longitud: -75.517, latitud:5°4'1" Norte, longitud: 75° 31' 1" oeste La recolección del material se realizo en la empresa Cenicafé en Chinchiná Caldas con coordenadas de extensión: 05°00'N,76°36'W. La recolección del material vegetal se realizó en cultivos de la empresa Cubikan Group, ubicada en Anserma Nuevo, Valle del Cauca, Colombia, con una temperatura media de 22,8 °C, una altura de 1,030 msnm, precipitación promedio anual de 1216 mm y una humedad relativa de 60 %. Latitud:4.7457177, Longitud:-76.0480080.

Sampling

Se evaluaron muestras de material vegetal recolectadas en las revuelterias de Manizales con la finalidad de obtener microorganimos fitopatógenos para docencia. Se recolecto muestra de la finca "La María" con la finalidad de determinar microorganismos con potencial controladores. Se recolecto muestras de la empresa Cenicafé con la finalidad de determinar bacterias acéticas u levaduras de residuos del proceso de fermentación de café para realizar bioinsumos a partir de estos. Se evaluaron dos genotipos comerciales de Cannabis medicinal (F3IP y F8IP) de la empresa Cubikan Group, las muestras fueron tomadas después del período de poscosecha en el momento que se dispone el material para ser empacado y entregado al departamento de valorización para la extracción de sus metabolitos de interés y la posterior elaboración de medicinas magistrales y productos cosméticos. De cada genotipo se tomaron 10 muestras, (cada una con un peso aproximado de 5 g), para el aislamiento e identificación In vitro de hongos presentes en las inflorescencias. Las muestras fueron colectadas en bolsas de polietileno estériles y transportadas en nevera con hielo seco, al laboratorio de Fitopatología del Departamento de Producción Agropecuaria de la Facultad de Ciencias Agropecuarias de la Universidad de Caldas, ubicada en la ciudad de Manizales – Caldas. Las muestras fueron colectadas de la tierra de las plataneras que se encuentran en el área verde de la Universidad esperando encontrar los hongos Fusarium sp. y Trichoderma sp., fueron colectadas en bolsas de polietileno estériles y llevadas en neveras portátiles al “Laboratorio de Agroindustria” de la Universidad Católica de Manizales.

Quality Control

Los microorganismos fueron aislados e identificados por personal especializado, hasta caracterización bioquímica y/o molecular, para la confirmación del mismo.

Method steps

1. Muestreo de los microorganismos en cultivos agrícolas.
2. Procesamiento de las muestras.
3. Aislamiento de los microorganismos.
4. Identificación de los microorganismos.
5. Conservación microorganismos en la Colección de Microorganismos de la Universidad Católica de Manizales-CMUCM.
6. Mantenimiento de los microorganismos en crioconservación a -80°C, agua destilada a temperatura ambiente y a -20°C.
7. Proceso de viabilidad de los microorganismos semestralmente

Hongos recolectados en plantas de plátano, bacterias recolectadas de verduras, levadura recolectados en fermentación del café, y hongo de biocontroladores del suelo. En total se colectaron 9 registros biológicos dos de ellos pertenecientes al reino Fungi, filo Ascomycota y se encuentra dividido en cuatro clases: Dothideomycetes, Eurotiomycetes, Saccharomycetes y Sordariomycetes, para 4 se encuentran en Dominio Bacteria, Filo Pseudomonadota y se encuentra dividido en clases: Gammaproteobacteria, y Betaproteobacteria. Un 33.34% está clasificado a nivel de especie y un 66.66% a género.

1. Alternaria
   rank: genus
2. Aspergillus westerdijkiae
   rank: species
3. Beauveria
   rank: genus
4. Burkholderia
   rank: genus
5. Candida dubliniensis
   rank: genus
6. Cladosporium
   rank: genus
7. Curvularia
   rank: genus
8. Erwinia
   rank: genus
9. Fusarium
   rank: genus
10. Fusarium incarnatum-equiseti
    rank: species
11. Pectobacterium
    rank: genus
12. Penicillium citrinum
    rank: species
13. Trichoderma
    rank: genus
14. Trichoderma asperellum
    rank: species
15. Xanthomonas
    rank: genus

Los microorganismos publicados fueron recolectados en los departamentos de Caldas y Valle del Cauca en Colombia, bajo el amparo del "Permiso Marco de Recolección de Especímenes de Especies Silvestres de la Diversidad Biológica con Fines de Investigación Científica No Comercial" dado por la Autoridad Nacional de Licencias Ambientales-ANLA.