Crustáceos de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CERBMcr-UV)

Study Extent

Pacífico colombiano y Caribe colombiano

Sampling

Los especímenes de crustáceos son colectados manualmente en su mayoría. Luego son fijados en alcohol al 70% y son envasados o empaquetados, con al menos un recambio de alcohol en el laboratorio. Finalmente son identificados hasta el nivel taxonómico más bajo posible y se les asigna su respectivo numero de catalogo para el ingreso a la colección de referencia. Por otro lado, respecto al proceso de curaduría en general, se realizó recambio de alcohol al 70% a los lotes que lo requirieron y se renovaron/agregaron nuevas etiquetas a los lotes donde estuvieran deterioradas o no las presentaran.

Quality Control

Se realizó una limpieza de datos inicial, completando y depurando toda la información de los registros biológicos en el formato DwC ver. 4.0. Se estandarizaron los datos de fechas y coordenadas usando las herramientas "Date parsing" y "Coordinate conversion" respectivamente, de la plataforma web Canadensys. Además, para completar los datos de georreferenciación, se utilizaron las herramientas "Google Earth Pro v.7.3.6.9285" y el "Geoportal de la división político-administrativa del DANE (Colombia)", apoyándose a su vez, en la información del sitio de colecta registrado en los lotes. Se realizó una verificación cruzada de todos los registros y se corrigieron errores de ortografía y tipografía, así como depuración de comas y dobles espacios, usando la herramienta OpenRefine 3.5.2. Finalmente, se rectificaron y corrigieron/actualizaron los nombres taxonómicos en los registros biológicos, usando la herramienta "Match Taxa" de la página web World Register of Marine Species (WoRMS).

Method steps

1. Curaduría de información: Recopilación de datos provenientes de los lotes
2. Estructuración global de la información en el formato Darwin Core versión 4.0
3. Depuración y completitud de la información faltante en los registros biológicos
4. Limpieza de datos: de aspectos de forma (ortografía, tipografía, comas y dobles espacios), rectificación/corrección de coordenadas, fechas y nombres taxonómicos en los registros.
5. Curaduría física: Se corroboró el estado del alcohol (en la colección húmeda), del recipiente/bolsa y de las etiquetas asociadas, reemplazando cada elemento por uno en perfectas condiciones en caso de ser requerido. En caso de que los organismos no estuvieran presentes en la colección, se reportaban como extraviados en la base de datos (CERBMcr-UV).

Los 1600 registros de crustáceos de la colección de referencia, están representados taxonómicamente por 3 clases, 9 órdenes, 79 familias, 156 géneros y 222 especies

1. Copepoda
   common name: Copepodos rank: class
2. Malacostraca
   rank: class
3. Ostracoda
   common name: Ostracodos rank: class
4. Amphipoda
   common name: Amfipodos rank: order
5. Decapoda
   common name: Cangrejos y Camarones rank: order
6. Isopoda
   common name: Isopodos rank: order
7. Myodocopida
   rank: order
8. Mysida
   rank: order
9. Podocopida
   rank: order
10. Stomatopoda
    common name: Camarones bravos rank: order
11. Tanaidacea
    common name: Tanaidaceos rank: order
12. Thecostraca
    rank: order

Este conjunto de datos posee información de los crustáceos del Pacífico colombiano, abarcando las regiones marino-costeras de los departamentos del Cauca, Valle del Cauca, Chocó y Nariño. En adición, se cuentan con 40 registros del Caribe colombiano, correspondientes a los departamentos del Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina, Bolívar, La Guajira, Magdalena y Sucre. Los rangos de profundidades están comprendidos desde los 0 metros (superficie) hasta los 750 metros (más profundo).