Colección de Microorganismos-Pontificia Universidad Javeriana

Study Extent

El área de estudio abarca todo el territorio colombiano.

Sampling

La colección de microorganismos de la Pontificia Universidad Javeriana (CMPUJ), agrupa múltiples muestreos, en los cuales podemos encontrar, muestreos sobre humanos, suelo, nematodos, plantas, entre otros.

Method steps

1. A continuación, se detalla el procedimiento para el depósito de microorganismos en la Colección de Microorganismos de la Pontificia Universidad Javeriana (CMPUJ): 1. Solicitud de depósito al correo de las encargadas de la colección
2. Solicitud y revisión de documentación solicitada (Carta formal solicitando el servicio de depósito, copia del permiso de colecta (obligatorio) y del permiso de acceso a recursos genéticos (si aplica), copia de reporte “relación de material recolectado” realizado frente a al ANLA, copia del certificado de la publicación de los datos en el Sistema de Información de Biodiversidad – SiB, plantilla DarwinCore diligenciada como se envió al SiB, formulario de depósito para el ingreso de las cepas a la colección, información asociada al microorganismo (descripciones, fotos si se tienen, secuencias, bioquímicas, etc).
3. Recepción del cultivo (2 cajas con medio de cultivo óptimo para el microorganismo y 3 viales con el método de conservación utilizado por el depositante) y asignación de un código CMPUJ por parte de la colección.
4. Revisión y autenticación del cultivo microbiano (evaluación de pureza y viabilidad) contrastando los resultados con el cultivo de caja y la información que envió el depositante.
5. Selección del método de conservación más adecuado para el microorganismo.
6. Elaboración de bancos, en donde se enviarán copias al depositante para su verificación junto con el formato respectivo.
7. Depósito en la colección, en donde se emite un certificado de depósito de la CMPUJ para los microrganismos una vez estén conservados.
8. Seguimiento de la pureza y viabilidad, monitoreados a los 3 meses, 6 meses, 12 meses, y de ahí en adelante anualmente hasta llegar a los años estipulados según la modalidad del depósito.

Actualmente, la colección tiene 593 especímenes, de los cuales hay 48 géneros, 44 especies y 1 variedad de hongos, 88 géneros 157 especies y 3 subespecies de bacterias y 5 especies de arqueas; con diferentes características, como: las nitrificantes, productoras de enzimas, de ambientes extremos, con condiciones anaerobias, con diferentes perfiles de susceptibilidad, entre otros. Adicionalmente, se documenta el historial de microorganismos que han estado en la colección y actualmente están dados de baja, teniendo 15 géneros de hongos, 65 géneros de bacterias y 4 géneros de arqueas.

1. Proteobacteria
   rank: phylum
2. Firmicutes
   rank: phylum
3. Actinobacteria
   rank: phylum
4. Bacteroidetes
   rank: phylum
5. Synergistetes
   rank: phylum
6. Thermotogae
   rank: phylum
7. Deinococcus-thermus
   rank: phylum
8. Ascomycota
   rank: phylum
9. Basidiomycota
   rank: phylum
10. Zygomycota
    rank: phylum
11. Halobacteria
    rank: class
12. Methanomicrobia
    rank: class
13. Methanobacteria
    rank: class
14. Thermoplasmata
    rank: class

Los datos registrados abarcan todo el territorio colombiano, incluyendo 12 departamentos como: Cundinamarca, Boyacá, Antioquia, entre otros; provenientes de diferentes fuentes de aislamiento. Adicionalmente, cuenta con registros provenientes de Argentina, Estados Unidos y Francia.