Plantas Vasculares del Uruguay (Observaciones Urtado et al.)
Citation
Urtado L, Rossi F, Cappuccio L, Teixeira de Mello F, Mai P, Grattarola F (2020). Plantas Vasculares del Uruguay (Observaciones Urtado et al.). Biodiversidata. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/ksffdg accessed via GBIF.org on 2024-08-24.Description
Este conjunto de datos contiene registros primarios de especies de plantas vasculares documentadas por Lucía Urtado, Florencia Rossi, Laura Cappuccio, Franco Teixeira de Mello y Patricia Mai en Uruguay, en el marco del proyecto ‘Adaptación de un índice de calidad de riberas para el monitoreo participativo del bosque ribereño en sistemas fluviales’, financiado por el Programa de Apoyo a la Investigación Estudiantil (PAIE-CSIC) de la Universidad de la República, Uruguay. Incluye 436 observaciones de 62 especies, realizadas en 2018, en el departamento de Maldonado. Estos datos forman parte de la base de datos de plantas vasculares de Biodiversidata, el Consorcio de Datos de Biodiversidad del Uruguay.Purpose
El proyecto ‘Adaptación de un índice de calidad de riberas para el monitoreo participativo del bosque ribereño en sistemas fluviales’, tuvo por objetivo la generación de un Índice de Calidad del bosque ribereño, para cuantificar de forma rápida el estado de conservación de estos ecosistemas, tomando en cuenta las características ambientales y de la vegetación para la cuenca del arroyo Maldonado, Uruguay.Sampling Description
Study Extent
El conjunto de datos reúne observaciones hechas en 29 sitios distribuidos en la cuenca del Arroyo Maldonado, entre la ruta 12 y la ruta 39 del Departamento de Maldonado, en el período entre abril y noviembre 2018.Sampling
El diseño de muestreo se basó en la delimitación de tres transectos de 20 m paralelas a la línea de ribera, ubicadas cada 10 m, donde se empleó el Método de Cuadrantes Centrados. Se ubicaron 5 cuadrantes por transecta dispuestos cada 5 m. Para cada cuadrante se consideraron aquellos individuos arbóreos con más de 5 cm de diámetro de tronco a la altura del pecho y más de 1,30 m de altura. Se midió la distancia al punto medio del cuadrante; el diámetro a la altura del pecho (DAP) de las ramas principales, en el caso de los individuos ramificados desde la base, se sumaron los diámetros de las tres ramificaciones mayores y se identificó la especie. De forma complementaria se realizó un muestreo cualitativo de la vegetación, basado en el método de “caminamiento” el cual consiste en registrar las especies que se identifican en un tramo del arroyo. Para ello se destinó un tiempo de veinte minutos donde se recorrió 50 mts del arroyo en ambas márgenes. De esta forma se buscó ampliar el listado de especies. A los efectos de la propuesta, ambas metodologías fueron aplicadas en 12 de los 30 sitios; en los sitios restantes solo se realizó el muestreo cualitativo.Quality Control
Se chequearon errores en los nombres científicos, localización geográfica y fechas de muestreo. Se agregaron datos sobre la autoría de los nombres científicos y se completaron los rangos taxonómicos desde Reino hasta el rango infraespecífico, se incluyó el término ‘taxonRank’ con información sobre el nivel de detalle de cada taxón. Se asignó a cada registro el nivel administrativo de Departamento y se incorporaron datos sobre la incertidumbre y precisión de la localización geográfica. El código de R utilizado para la limpieza de datos está disponible en nuestro repositorio de GitHub (https://github.com/bienflorencia/rBiodiversidata).Method steps
- Verificación de errores ortográficos de nombres científicos usando los paquetes de R 'taxize' (Chamberlain et al. 2020) y 'WorldFlora' (Kindt 2020). Para verificar los nombres primero contrastamos la lista de especies con la referencia taxonómica de World Flora Online (WFO) (http://www.worldfloraonline.org/), si la especie o su sinónimo sugeridos por WFO fuera aceptado según Zuloaga et al. (2019) en Darwinion (http://www.darwin.edu.ar), conservamos el nombre y el ‘taxonID’ de WFO, de lo contrario, utilizamos el nombre de Darwinion y buscamos una ‘taxonID’ en Tropicos (https://www.tropicos.org/). El nombre original de la especie se mantuvo bajo el término ‘previousIdentifications’. La lista final de nombres científicos fue verificada por los expertos en plantas de Biodiversidata.
- Determinación de rangos taxonómicos superiores (Reino, Filo, Clase, Orden, Familia y Género), inclusión del término de rango infraespecífico y la autoridad taxonómica para los nombres científicos.
- Incorporación del término ‘establishmentMeans’ categorizando a las especies en nativas o introducidas según Andrade et al. (2018).
- Verificación de valores atípicos o inexactos en la localización geográfica. Incorporación de los campos de incertidumbre y precisión para los valores de latitud y longitud proporcionados.
- Estandarización del estado/provincia geográfica a través de la base de datos del GeoNames Gazetteer utilizando el paquete R 'geonames' (Rowlingson 2019). Inclusión de términos estándares para los rangos geográficos más altos que el nivel de localidad (continente y país).
Additional info
Las personas involucradas fueron Lucía Urtado (responsable del proyecto), Florencia Rossi, Laura Cappuccio, Franco Teixeira de Mello (tutor), Patricia Mai (co-tutora). El proyecto contó con financiación del Programa de Apoyo a la Investigación Estudiantil de la Comisión Sectorial de Investigación Científica, Universidad de la República (PAIE-CSIC, UdelaR).Taxonomic Coverages
Se registraron un total de 62 especies de plantas vasculares (56 nativas), distribuidas en 32 familias y 48 géneros.
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Tracheophytacommon name: Plantas Vasculares rank: phylum
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Magnoliopsidarank: class
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Liliopsidarank: class
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Polypodiopsidarank: class
Geographic Coverages
La cobertura geográfica incluye 29 sitios en el departamento de Maldonado, Uruguay.
Bibliographic Citations
- Andrade BO, Marchesi E, Burkart S, Setubal RB, Lezama F, Perelman S, Schneider AA, Trevisan R, Overbeck GE, Boldrini II (2018) Vascular plant species richness and distribution in the Río de la Plata grasslands. Botanical Journal of the Linnean Society 188: 6. - https://doi.org/10.1093/botlinnean/boy063
- Chamberlain S, Szoecs E, Foster Z, Arendsee Z, Boettiger C, Ram K, Bartomeus I, Baumgartner J, O'Donnell J, Oksanen J, Tzovaras BG, Marchand P, Tran V, Salmon M, Li G, Grenié M (2020) taxize: Taxonomic information from around the web. R package version 0.9.92. - https://cran.r-project.org/web/packages/taxize
- Grattarola F, Botto G, da Rosa I, Gobel N, González EM, González J, Hernández D, Laufer G, Maneyro R, Martínez-Lanfranco JA, Naya DE, Rodales AL, Ziegler L, Pincheira-Donoso D (2019) Biodiversidata: An Open-Access Biodiversity Database for Uruguay. Biodiversity Data Journal 7. - https://doi.org/10.3897/BDJ.7.e36226
- Kindt R (2020) WorldFlora: An R package for exact and fuzzy matching of plant names against the World Flora Online Taxonomic Backbone data. bioRxiv. - https://doi.org/10.1101/2020.02.02.930719
- Rowlingson B (2019) Interface to the "Geonames" Spatial Query Web Service. R package version 0.999. - https://cran.r-project.org/web/packages/geonames/
- Zuloaga FO, Belgrano MJ, Zanotti CA (2019) Actualización del Catálogo de las Plantas Vasculares del Cono Sur. Darwiniana, nueva serie 7: 70. - https://doi.org/10.14522/darwiniana.2019.72.861
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Lucía Urtadooriginator
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