Methanocaldococcus jannaschii (Jones et al., 1984) Whitman, 2002

Dataset
German Wikipedia - Species Pages: Rank
SPECIES

Classification

class
Methanococci: order
Methanococcales: family
Methanocaldococcaceae: genus
Methanocaldococcus: species
Methanocaldococcus jannaschii

Abstract

386x386px|mini|Das Bild zeigt das Forschungstauchboot Alvin ein Jahr nach der ersten Erkundungsfahrt zu einer Hydrothermal-Quelle (Foto NOAA, 1978). Die Alvin barg auch das Archaeon M. jannaschi von der Kaminbasis eines „Weißen Rauchers“ am Meeresboden (Ostpazifischer Rücken, 20°50'N,109°06'W, 2600 Meter Tiefe). Methanocaldococcus jannaschii (früher Methanococcus jannaschii) ist taxonomisch eine Art von prokaryotischen Mikroorganismen. M. jannaschii gehört als Methanbildner zur Domäne der Lebewesen Archaea. M. jannaschii wurde mit einem U-Boot der Woods Hole Oceanographic Institution aus einer hydrothermalen Quelle isoliert, ist thermophil und bildet Methan. Es war das erste Archaeon, dessen komplettes Genom sequenziert wurde.C. J. Bult, O. White, G. J. Olsen, L. Zhou, R. D. Fleischmann, G. G. Sutton, J. A. Blake, L. M. FitzGerald, R. A. Clayton, J. D. Gocayne, A. R. Kerlavage, B. A. Dougherty, J. F. Tomb, M. D. Adams, C. I. Reich, R. Overbeek, E. F. Kirkness, K. G. Weinstock, J. M. Merrick, A. Glodek, J. L. Scott, N. S. Geoghagen, J. C. Venter: Complete genome sequence of the methanogenic archaeon, Methanococcus jannaschii. In: Science. Band 273, Nummer 5278, August 1996, S. 1058–1073, PMID 8688087. Laut Craig Venter, unter dessen Federführung dieses Sequenzierungsprojekt lief, waren die einzigartigen Merkmale des Genoms ein starker Beweis dafür, dass es drei Domänen von Lebewesen gibt.

Datenbanken

LPSN für die Suche nach Methanocaldococcus → http://www.bacterio.net/methanocaldococcus.html NCBI taxonomy browser für die Suche nach M. jannaschii → https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=2190 MicrobeWiki für die Suche nach M. jannaschii → http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Methanococcus_jannaschii UCSC genome browser für die Suche nach M. jannaschii → http://microbes.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway?db=methJann1 KEGG für die Suche nach M. jannaschii → http://www.genome.jp/kegg-bin/show_organism?org=mja BacDive für die Suche nach Kulturstämmen von M. jannaschii → http://bacdive.dsmz.de/index.php?search=6981&submit=Search

Eigenschaften und Stoffwechsel

Methanocaldococcus jannaschii ist ein thermophiler, methanogener Organismus, was bedeutet, dass durch Methanogenese Methan als Nebenprodukt des Stoffwechsels entsteht. Das Archaeon kann nur mit Kohlendioxid und Wasserstoff als primäre Energiequellen wachsen; das steht im Gegensatz zu vielen anderen „Methanokokken“ (wie Methanococcus maripalidus), die auch Formiat als primäre Energiequelle verwenden können. Das Genom umfasst viele Hydrogenasen, wie eine 5,10-Methenyltetrahydromethanopterin-Hydrogenase,E. J. Lyon, S. Shima, G. Buurman, S. Chowdhuri, A. Batschauer, K. Steinbach, R. K. Thauer: UV-A/blue-light inactivation of the 'metal-free' hydrogenase (Hmd) from methanogenic archaea. In: European Journal of Biochemistry. Band 271, Nummer 1, Januar 2004, S. 195–204, PMID 14686932. eine Ferredoxin-Hydrogenase (eha) und eine Coenzym-F420-Hydrogenase.Rudolf K. Thauer, Anne-Kristin Kaster, Meike Goenrich, Michael Schick, Takeshi Hiromoto, Seigo Shima: Hydrogenases from Methanogenic Archaea, Nickel, a Novel Cofactor, and H Storage. In: Annual Review of Biochemistry. 79, 2010, S. 507, doi:10.1146/annurev.biochem.030508.152103. M. jannaschii hat eine große Anzahl von Inteinen; in einer Proteomik-Studie wurden 19 Intenine entdeckt.W. Zhu, C. I. Reich, G. J. Olsen, C. S. Giometti, J. R. Yates: Shotgun proteomics of Methanococcus jannaschii and insights into methanogenesis. In: Journal of Proteome Research. Band 3, Nummer 3, 2004 May-Jun, S. 538–548, PMID 15253435. Viele neuartige Stoffwechselwege wurden in M. jannaschii erarbeitet, einschließlich der Synthesewege für methanogene CofaktorenR. H. White: Biosynthesis of the methanogenic cofactors. In: Vitamins and hormones. Band 61, 2001, S. 299–337, PMID 11153270 (Review)., RiboflavinI. Haase, S. Mörtl, P. Köhler, A. Bacher, M. Fischer: Biosynthesis of riboflavin in archaea. 6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase of Methanococcus jannaschii. In: European Journal of Biochemistry. Band 270, Nummer 5, März 2003, S. 1025–1032, PMID 12603336. und Polyamine (z. B.D. E. Graham, H. Xu, R. H. White: Methanococcus jannaschii uses a pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase in polyamine biosynthesis. In: Journal of Biological Chemistry. Band 277, Nummer 26, Juni 2002, S. 23500–23507, doi:10.1074/jbc.M203467200, PMID 11980912.). Außerdem wurde eine archaeenspezifische DNA-Polymerasefamilie untersucht.Y. Ishino, K. Komori, I. K. Cann, Y. Koga: A novel DNA polymerase family found in Archaea. In: Journal of bacteriology. Band 180, Nummer 8, April 1998, S. 2232–2236, PMID 9555910, . In der Membranome-Datenbank wurden Informationen zu Single-Pass-Transmembranproteinen von M. jannaschii zusammengestellt (z. B.A. L. Lomize, M. A. Lomize, S. R. Krolicki, I. D. Pogozheva: Membranome: a database for proteome-wide analysis of single-pass membrane proteins. In: Nucleic acids research. Band 45, D101 2017, S. D250–D255, doi:10.1093/nar/gkw712, PMID 27510400, .).

Systematik

2002 ist eine Veröffentlichung erschienen, in der die Domäne Archaea behandelt wird (Buchband). Unter anderem werden dort das Phylum Euryarchaeota (Buchkapitel) und die darin verankerte neue Klasse Methanococci (Buchabschnitt) beschrieben. Der Abschnitt zur neuen Klasse Methanococci ist mit den darin enthaltenen neuen Taxa und Umgruppierungen, unter anderem mit dem neuen Artnamen Methanocaldococcus jannaschii durch die Internationale Vereinigung der Mikrobiologischen Gesellschaften (IUMS) bestätigt worden. Themenrelevante Veröffentlichungen zeitlich geordnet

Jones et al. (1983) — Effektive Veröffentlichung zur neuen Art Methanococcus jannaschii.W. J. Jones, J. A. Leigh, F. Mayer, C. R. Woese, R. S. Wolfe: Methanococcus jannaschii sp. nov., an extremely thermophilic methanogen from a submarine hydrothermal vent. In: Archives of Microbiology. 136, 1983, S. 254, doi:10.1007/BF00425213. IUMS (1984) — Liste Nummer 16, offizielle Veröffentlichung der Internationalen Vereinigung der Mikrobiologischen Gesellschaften (IUMS) zur Gültigmachung von Namen, u. a. „Methanococcus jannaschii JONES et al. 1984“. Whitman (2001) — Effektive Veröffentlichung zur Gattung Methanocaldococcus, u. a. mit der Art Methanocaldococcus jannaschii, die auf der Grundlage des Basonyms Methanococcus jannaschii neu kombiniert wurde (comb. nov.). IUMS (2002) — Validierungsliste Nummer 85, offizielle Veröffentlichung der Internationalen Vereinigung der Mikrobiologischen Gesellschaften (IUMS) zur Gültigmachung von Namen, u. a. für die Art „Methanocaldococcus jannaschii (JONES et al. 1984) WHITMAN 2002“.International Union of Microbiological Societies: VALIDATION LIST No. 85; Validation of publication of new names and new combinations previously effectively published outside the IJSEM. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. In: International journal of systematic and evolutionary microbiology. Band 52, Mai 2002, S. 685–690, doi:10.1099/00207713-52-3-685, PMID 12054225.

Weitere Literatur

Lee et al. (2013) — E. H. Lee, K. Lee, K. Y. Hwang: Structural characterization and comparison of the large subunits of IPM isomerase and homoaconitase from Methanococcus jannaschii. In: Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography. Band 70, Pt 4 April 2014, S. 922–931, doi:10.1107/S1399004713033762, PMID 24699638. Wang et al. (2013) — X. Wang, Y. Yuan, M. Teng, L. Niu, Y. Gao: Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of MJ0458, an adenylate kinase from Methanocaldococcus jannaschii. In: Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications. Band 69, Pt 11 November 2013, S. 1272–1274, doi:10.1107/S1744309113026638, PMID 24192367, . Allen et al. (2014) — K. D. Allen, H. Xu, R. H. White: Identification of a unique radical S-adenosylmethionine methylase likely involved in methanopterin biosynthesis in Methanocaldococcus jannaschii. In: Journal of bacteriology. Band 196, Nummer 18, September 2014, S. 3315–3323, doi:10.1128/JB.01903-14, PMID 25002541, . Wang et al. (2014) — Y. Wang, H. Xu, R. H. White: β-alanine biosynthesis in Methanocaldococcus jannaschii. In: Journal of bacteriology. Band 196, Nummer 15, August 2014, S. 2869–2875, doi:10.1128/JB.01784-14, PMID 24891443, .

Name

Homonyms: Methanocaldococcus jannaschii (Jones et al., 1984) Whitman, 2002
Common names: 10.1128/JB.01784-14 in language.