Alphaproteobacteria Garrity et al., 2006
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Classification
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- Alphaproteobacteria
Abstract
Alphaproteobacteria (auch α-Proteobacteria) bezeichnet eine Klasse im phylogenetischen System der Bakterien, das auf der Grundlage der Basensequenz der ribosomalen 16S-Ribonukleinsäure (16S-rRNA) aufgestellt wurde. Sie gehören zum Stamm (Phylum) der Proteobacteria,
Systematik
Zu den Alphaproteobacteria gehören die OrdnungenJ.P. Euzéby: List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) - Class Alphaproteobacteria (Stand: 11. Januar 2019)
Caulobacterales 1935 Iodidimonadales 2016 Kiloniellales 2009 Kordiimonadales 2005 Magnetococcales 2013 Micropepsales 2017 Parvularculales 2003 Rhizobiales 2006 Rhodobacterales 2006 Rhodospirillales 1971 Rickettsiales 1939 Sneathiellales 2008 Sphingomonadales 2006
sowie
Pelagibacterales 2012Pelagibacterales, auf: NCBI Taxonomy Browser Holosporales 2013; 2018
und zahlreiche, bisher nicht sicher eingeordnete Isolate. Wichtige Vertreter sind unter anderem in den Gattungen Rhodospirillum, Acetobacter, Rickettsia, Paracoccus, Zymomonas, Rhizobium, Bartonella, Brucella und Nitrobacter zu finden. Unter den Alphaproteobakterien kommen zahlreiche aquatisch lebende Arten vor. Hohe Anteile dieser Bakterien in Gewässerproben zeigen oft oligotrophe Verhältnisse an.
Die Rickettsiales werden dabei als ein Taxon verstanden, das die Anaplasmataceae, Ricketsiaceae und Midichloriaceae umfasst. Werden die Proto-Mitochondrien ebenfalls mit einbezogen, dann erscheinen im obigen Kladogramm die Rickettsiales als Schwestergruppe der Pelagibacterales (wären also der Zweig unterhalb dieser); vielleicht stellen letztere aber auch eine basale Untergruppe der Rickettsiales dar. Details zu den Caulobacteridae siehe Parvularcula bermudensis. Weitere hier nicht aufgeführte Taxa der Alphaproteobacteria sind (wo nicht eigens vermerkt gemäß List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) und National Center for Biotechnology Information (NCBI) sowie der 16S-rRNA-basierten Phylogenie nach Release 106 des Projekts "The All-Species Living Tree") unter anderem:
Sneathiellales mit Sneathiella chinensis, S. chungangensis, S. glossodoripedis (basal in RickettsialesSneathiella, auf: LPSNSneathiella glossodoripedis, auf: UniProt oder zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013)) Parvularculales mit Parvularcula bermudensis (nahe Rhodobacterales/Rhizobiales, Caulobacteridae)Jang-Cheon Cho, Stephen J. Giovannoni: Parvularcula bermudensis gen. nov., sp. nov., a marine bacterium that forms a deep branch in the α-Proteobacteria. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology Band 53, Nr. 4, Juli 2003, S. 1031–1036, . doi:10.1099/ijs.0.02566-0. PMID 12892122. Iodidimonadales mit Iodidimonas muriaeGenus Iodidimonas, auf LPSN zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013) Kiloniellales mit Kiloniella laminarae zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013) Kordiimonadales mit Kordiimonas gwangyangensisOrder Kordiimonadales, auf LPSN zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013) Micropepsales mit Micropepsis pineolensis (incerta sedis)Order Micropepsales, auf LPSN Rhodovibrio mit Rhodovibrio salinarum, R. sodomensis (Rhodospirillaceae, Caulobacteridae)Rhodovibrio salinarum, auf: BacDive Micavibrio aeruginosavorus 2005 (incerta sedis) Vibrio adaptatus und V. cyclosites (nach Muir et al. 1990 nicht Gattung Vibrio, sondern bisher nicht bezeichnete Gattung(en) der Alphaproteobacteria, incerta sedis) Furvibacter 2007 Polymorphum gilvum 2010 Subaequorebacter tamlense 2006Subaequorebacter, auf: NCBI Taxonomy Browser Tuberoidobacter mutans 1983Advances in Microbial Physiology, Vol. 24, Academic Press, 12. Juli 1983, ISBN 0-12-027724-7, S. 111Tuberoidobacter, on: IniProt TaxonomyTuberoidobacter, auf: NCBI Taxonomy Browser
Caulobacterales 1935 Iodidimonadales 2016 Kiloniellales 2009 Kordiimonadales 2005 Magnetococcales 2013 Micropepsales 2017 Parvularculales 2003 Rhizobiales 2006 Rhodobacterales 2006 Rhodospirillales 1971 Rickettsiales 1939 Sneathiellales 2008 Sphingomonadales 2006
sowie
Pelagibacterales 2012Pelagibacterales, auf: NCBI Taxonomy Browser Holosporales 2013; 2018
und zahlreiche, bisher nicht sicher eingeordnete Isolate. Wichtige Vertreter sind unter anderem in den Gattungen Rhodospirillum, Acetobacter, Rickettsia, Paracoccus, Zymomonas, Rhizobium, Bartonella, Brucella und Nitrobacter zu finden. Unter den Alphaproteobakterien kommen zahlreiche aquatisch lebende Arten vor. Hohe Anteile dieser Bakterien in Gewässerproben zeigen oft oligotrophe Verhältnisse an.
Die Rickettsiales werden dabei als ein Taxon verstanden, das die Anaplasmataceae, Ricketsiaceae und Midichloriaceae umfasst. Werden die Proto-Mitochondrien ebenfalls mit einbezogen, dann erscheinen im obigen Kladogramm die Rickettsiales als Schwestergruppe der Pelagibacterales (wären also der Zweig unterhalb dieser); vielleicht stellen letztere aber auch eine basale Untergruppe der Rickettsiales dar. Details zu den Caulobacteridae siehe Parvularcula bermudensis. Weitere hier nicht aufgeführte Taxa der Alphaproteobacteria sind (wo nicht eigens vermerkt gemäß List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) und National Center for Biotechnology Information (NCBI) sowie der 16S-rRNA-basierten Phylogenie nach Release 106 des Projekts "The All-Species Living Tree") unter anderem:
Sneathiellales mit Sneathiella chinensis, S. chungangensis, S. glossodoripedis (basal in RickettsialesSneathiella, auf: LPSNSneathiella glossodoripedis, auf: UniProt oder zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013)) Parvularculales mit Parvularcula bermudensis (nahe Rhodobacterales/Rhizobiales, Caulobacteridae)Jang-Cheon Cho, Stephen J. Giovannoni: Parvularcula bermudensis gen. nov., sp. nov., a marine bacterium that forms a deep branch in the α-Proteobacteria. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology Band 53, Nr. 4, Juli 2003, S. 1031–1036, . doi:10.1099/ijs.0.02566-0. PMID 12892122. Iodidimonadales mit Iodidimonas muriaeGenus Iodidimonas, auf LPSN zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013) Kiloniellales mit Kiloniella laminarae zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013) Kordiimonadales mit Kordiimonas gwangyangensisOrder Kordiimonadales, auf LPSN zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013) Micropepsales mit Micropepsis pineolensis (incerta sedis)Order Micropepsales, auf LPSN Rhodovibrio mit Rhodovibrio salinarum, R. sodomensis (Rhodospirillaceae, Caulobacteridae)Rhodovibrio salinarum, auf: BacDive Micavibrio aeruginosavorus 2005 (incerta sedis) Vibrio adaptatus und V. cyclosites (nach Muir et al. 1990 nicht Gattung Vibrio, sondern bisher nicht bezeichnete Gattung(en) der Alphaproteobacteria, incerta sedis) Furvibacter 2007 Polymorphum gilvum 2010 Subaequorebacter tamlense 2006Subaequorebacter, auf: NCBI Taxonomy Browser Tuberoidobacter mutans 1983Advances in Microbial Physiology, Vol. 24, Academic Press, 12. Juli 1983, ISBN 0-12-027724-7, S. 111Tuberoidobacter, on: IniProt TaxonomyTuberoidobacter, auf: NCBI Taxonomy Browser
Name
- Homonyms
- Alphaproteobacteria Garrity et al., 2006
- Alphaproteobacteria
- Common names
- 10.1099/ijs.0.02566-0 in language.