Thermococci Zillig & Reysenbach, 2002
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Classification
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Abstract
mini|295px|Schemazeichnung der obigen Zelle von Thermococcus gammatolerans Die Thermococci ( „Thermokokken“, Synonym Protoarchaea) sind eine Klasse von Archaeen im Phylum Euryarchaeota. Die Thermococcales bilden eine allgemein anerkannte Ordnung (Biologie) innerhalb der Thermococci.NCBI: Thermococci und Thermococci Zillig and Reysenbach 2002 (class); graphisch: Thermococci, auf: LifeMap NCBI Version.Thermococci, auf: OneZoomLPSN: Thermococci Zillig and Reysenbach 2002WoRMS: Thermococci (Bitte den Schalter „marine only“ deaktivieren)
Methanophastidiosales
Methanophastidiosales ist eine vorgeschlagene Bezeichnung für eine Gruppe von Euryarchaeota im taxonomischen Rang einer Ordnung, die ursprünglich WSA2 oder Arc I genannt wurde. Diese Archaeen gelten als die ersten entdeckten Methanbildner, das sich auf die Methanogenese durch Reduktion von methyliertem Thiol beschränken. Genomanalysen zeigen, dass ihnen Stoffwechselwege zur Kohlenstofffixierung, Stickstofffixierung und Biosynthese vieler Aminosäuren fehlen. Als Kohlenstoffquelle können sie Acetat, Malonat und Propionat verwenden. Diese Archaeen finden sich in brackigen Meeressedimenten, hydrothermalen Sedimenten, mesophilen anaeroben Fermentern, in Kläranlagenwasser und -sedimenten, Deponiesickerwasser, erdölkontaminiertem Grundwasser usw. Die Taxonomie dieser Gruppe als Ordnung der Klasse Thermococci ist noch in der Diskussion; eine andere Klassifizierung ist als eigene Klasse Methanofastidiosa innerhalb einer Stenosarchaea genannten Euryarchaeota-Klade.
Systematik
Mit Stand Dezember 2021 hat die Klasse Thermococci die eine allgemein akzeptierte Ordnung Thermococcales; zudem wurde vorgeschlagen, eine weitere Ordnung Methanofastidiosales in die Klasse aufzunehmen:Genome Database (GTDB): Thermococci mini|295px|Pyrococcus furiosus Klasse Thermococci 2002mit Synonym Protoarchaea 2002
Ordnung Thermococcales 1988
Familie Thermococcaceae 1988
Gattung Palaeococcus et al. 2000
Spezies P. ferrophilus et al. 2000 Spezies P. helgesonii et al. 2006 Spezies P. pacificus et al. 2013 Gattung Pyrococcus 1986
Spezies P. furiosus 1986 Spezies P. glycovorans et al. 1999 Spezies P. orikoshii et al. 1999 Spezies P. kukulkanii et al. 2016 Spezies P. woesei Zillig 1988 Spezies P. yayanosii et al. 2011 Gattung Thermococcus 1983
Spezies T. acidaminovorans et al. 2001 Spezies T. aciditolerans et al. 2021 Spezies T. aegaeus corrig. et al. 2000 (mit Schreibvariante T. aegaeicus) Spezies T. aggregans et al. 1998 Spezies T. alcaliphilus et al. 1997 Spezies T. atlanticus et al. 2004 Spezies T. barophilus et al. 1999 Spezies T. barossii et al. 2005 Spezies T. camini et al. 2021 Spezies T. celer 1983 Spezies T. celericrescens et al. 2007 Spezies T. chitonophagus 1996 Spezies T. cleftensis et al. 2014 Spezies T. coalescens et al. 2005 Spezies T. eurythermalis et al. 2015 Spezies T. fumicolans 1996 Spezies T. gammatolerans et al. 2003 Spezies T. gorgonarius et al. 1998 Spezies T. guaymasensis et al. 1998 Spezies T. henrietii et al. 2021 Spezies T. hydrothermalis et al. 1997 Spezies T. indicus et al. 2021 Spezies T. kodakarensis corrig. et al. 2005 (mit Schreibvariante T. kodakaraensis, ehemals Pyrococcus sp. KOD1) Spezies T. litoralis et al. 2001 Spezies T. pacificus et al. 1998 Spezies T. paralvinellae et al. 2014 Spezies T. peptonophilus et al. 1996 Spezies T. piezophilus et al. 2017 Spezies T. prieurii et al. 2013 Spezies T. profundus corrig. 1995 Spezies T. sibiricus et al. 2001 Spezies T. siculi et al. 2000 Spezies T. stetteri 1990 Spezies T. thioreducens et al. 2007 Spezies T. waiotapuensis et al. 2001 Spezies T. zilligii et al. 1999 ?Ordnung Methanofastidiosales
Familie MethanofastidiosaceaeStefano Fazi et al.: High concentrations of dissolved biogenic methane associated with cyanobacterial blooms in East African lake surface water. In: Nature Communications, Band 4, Nr. 845, 7. Juli 2021, doi:10.1038/s42003-021-02365-x.
Genus Ca. Methanofastidiosum alias Arc I group oder WSA2 group
Spezies Ca. M. methylthiophilum et al. 2016 (mit Schreibvariante Ca. M. methylthiophilus) inkl. Arc I group archaeon ADurb1013_Bin02101
Typus-Taxa sind fett hervorgehoben. Abgesehen von der Gattung Ca. Methanofastidiosum sind hier nur als gesichert gelistete Spezies angegeben. Eine alternative Zuordnung der Gattung Ca. Methanofastidiosum geschieht nach LPSN und NCBI in eine eigene Klasse Ca. Methanofastidiosa corrig. et al. 2016, Klade Stenosarchaea et al. 2018 innerhalb der Euryarchaeota.LPSN: Genus "Candidatus Methanofastidiosum"NCBI: "Candidatus Methanofastidiosum" Nobu et al. 2016 (genus); graphisch: Candidatus Methanofastidiosum, auf: LifeMap NCBI Version.
Ordnung Thermococcales 1988
Familie Thermococcaceae 1988
Gattung Palaeococcus et al. 2000
Spezies P. ferrophilus et al. 2000 Spezies P. helgesonii et al. 2006 Spezies P. pacificus et al. 2013 Gattung Pyrococcus 1986
Spezies P. furiosus 1986 Spezies P. glycovorans et al. 1999 Spezies P. orikoshii et al. 1999 Spezies P. kukulkanii et al. 2016 Spezies P. woesei Zillig 1988 Spezies P. yayanosii et al. 2011 Gattung Thermococcus 1983
Spezies T. acidaminovorans et al. 2001 Spezies T. aciditolerans et al. 2021 Spezies T. aegaeus corrig. et al. 2000 (mit Schreibvariante T. aegaeicus) Spezies T. aggregans et al. 1998 Spezies T. alcaliphilus et al. 1997 Spezies T. atlanticus et al. 2004 Spezies T. barophilus et al. 1999 Spezies T. barossii et al. 2005 Spezies T. camini et al. 2021 Spezies T. celer 1983 Spezies T. celericrescens et al. 2007 Spezies T. chitonophagus 1996 Spezies T. cleftensis et al. 2014 Spezies T. coalescens et al. 2005 Spezies T. eurythermalis et al. 2015 Spezies T. fumicolans 1996 Spezies T. gammatolerans et al. 2003 Spezies T. gorgonarius et al. 1998 Spezies T. guaymasensis et al. 1998 Spezies T. henrietii et al. 2021 Spezies T. hydrothermalis et al. 1997 Spezies T. indicus et al. 2021 Spezies T. kodakarensis corrig. et al. 2005 (mit Schreibvariante T. kodakaraensis, ehemals Pyrococcus sp. KOD1) Spezies T. litoralis et al. 2001 Spezies T. pacificus et al. 1998 Spezies T. paralvinellae et al. 2014 Spezies T. peptonophilus et al. 1996 Spezies T. piezophilus et al. 2017 Spezies T. prieurii et al. 2013 Spezies T. profundus corrig. 1995 Spezies T. sibiricus et al. 2001 Spezies T. siculi et al. 2000 Spezies T. stetteri 1990 Spezies T. thioreducens et al. 2007 Spezies T. waiotapuensis et al. 2001 Spezies T. zilligii et al. 1999 ?Ordnung Methanofastidiosales
Familie MethanofastidiosaceaeStefano Fazi et al.: High concentrations of dissolved biogenic methane associated with cyanobacterial blooms in East African lake surface water. In: Nature Communications, Band 4, Nr. 845, 7. Juli 2021, doi:10.1038/s42003-021-02365-x.
Genus Ca. Methanofastidiosum alias Arc I group oder WSA2 group
Spezies Ca. M. methylthiophilum et al. 2016 (mit Schreibvariante Ca. M. methylthiophilus) inkl. Arc I group archaeon ADurb1013_Bin02101
Typus-Taxa sind fett hervorgehoben. Abgesehen von der Gattung Ca. Methanofastidiosum sind hier nur als gesichert gelistete Spezies angegeben. Eine alternative Zuordnung der Gattung Ca. Methanofastidiosum geschieht nach LPSN und NCBI in eine eigene Klasse Ca. Methanofastidiosa corrig. et al. 2016, Klade Stenosarchaea et al. 2018 innerhalb der Euryarchaeota.LPSN: Genus "Candidatus Methanofastidiosum"NCBI: "Candidatus Methanofastidiosum" Nobu et al. 2016 (genus); graphisch: Candidatus Methanofastidiosum, auf: LifeMap NCBI Version.
Thermococcales
Die Ordnung Thermococcales umfasst nur die Familie Thermococcaceae mit ca. 40 oder mehr Spezies (Arten), was sie zu einer der zahlreichsten Familie in der Domäne der Archaeen macht, wobei bisher wahrscheinlich nur ein kleiner Teil der natürlich vorkommenden Arten dieser Gruppe untersucht ist. Diese Organismen sind hyperthermophil, d. h. sie leben in extrem heißen Umgebungen (z. B. in Hydrothermalquellen) bei optimalen Wachstumstemperaturen von über 80 °C. In solchen marinen Umgebungen sind sie weit verbreitet. Thermococci gehören zu den am häufigsten isolierten Organismen aus hydrothermalen Schloten in der Tiefsee. Vertreter wurden auch aus Ölfeldvorkommen und flachen hydrothermalen Meeresgebieten isoliert, allerdings noch nie von hydrothermalen Quellen an Land. Bei Ausbrüchen unterseeischer Vulkane wurden Thermococci in hohen Konzentrationen im umgebenden Meerwasser nachgewiesen. Die Gattungen Thermococcus und Pyrococcus (wörtlich „Wärmeball“ und „Feuerball“) sind beide obligat anaerobe Chemoorganotrophe. Thermococcus bevorzugt 70–95 °C und Pyrococcus 70–100 °C. Thermococcus gammatolerans wurde beispielsweise im Guaymas-Becken entdeckt und wächst bei Temperaturen von 55–95 °C (optimale 88 °C) bei einem optimalen pH-Wert von 6. Diese Spezies (Art) hat eine ausgeprägte Strahlungsresistenz und kann Gammastrahlung von 30 kGy (Kilo-Gray) überleben.Edmond Jolivet, Stéphane L'Haridon, Erwan Corre, Patrick Forterre, Daniel Prieur: Thermococcus gammatolerans sp. nov., a hyperthermophilic archaeon from a deep-sea hydrothermal vent that resists ionizing radiation. In: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., Band 53, Nr. Pt 3, Mai 2003, S. 847–851, doi:10.1099/ijs.0.02503-0, PMID 12807211. Vertreter der Gattung Thermococcus wurden auch in terrestrischen hydrothermalen Gewässern in Neuseeland gefunden. Palaeococcus helgesonii aus dem Tyrrhenischen Meer ist ein aerober chemoheterotropher Organismus, der bei Temperaturen von 45–85 °C (optimal 80 °C) wächst.Jan P. Amend, D'Arcy R. Meyer-Dombard, Seema N. Sheth, Natalya Zolotova, Andrea C. Amend: Palaeococcus helgesonii sp. nov., a facultatively anaerobic, hyperthermophilic archaeon from a geothermal well on Vulcano Island, Italy. In: Archives of Microbiology, Band 179, Nr. 6, April/Juni 2003, S. 394–401, doi:10.1007/s00203-003-0542-7.K. L. Rogers, Jan P. Amend: Archaeal diversity and geochemical energy yields in a geothermal well on Vulcano Island, Italy. In: Geobiolog, Band 3, Nr. 4, Oktober 2005/3. März 2006, S. 319–332, doi:10.1111/j.1472-4669.2006.00064.x Mit Stand 2012 lagen keine Daten zur Besiedlung von Thermokokken Niedrigtemperatur-Ökosystemen sowie in Umgebungen mit hohem oder niedrigem pH-Wert vor.
Name
- Homonyms
- Thermococci Zillig & Reysenbach, 2002
- Common names
- 10.1038/ismej.2016.33 in language.